24小时热门版块排行榜    

查看: 2242  |  回复: 14

julietguo

银虫 (正式写手)

[求助] 提RNA反转录后,用GAPDH和TLR进行PCR,可是GAPDH条带很亮,TLR怎么都出不来

各位大侠,我最近提了RAW264.7细胞的RNA,反转录后,用GAPDH和TLR进行PCR,可是GAPDH条带很亮,TLR怎么都出不来。
第一次加了6微升DEPC水溶解RNA,然后取5微升RNA溶液作RT-PCR(20微升体系),再分别用GAPDH和TLR2进行PCR。
图见1
第二次取500ng 小鼠肺组织、RAW264.7细胞的总RNA,进行逆转,用的是M-MLV的酶,按照protocol上的10微升体系,在用TLR1和GAPDH进行PCR。结果还是只有很亮的GAPDH,不过两次PCR都有很多引物二聚体。
见图2
谁能告诉我这到底是为什么呀~~~

1 MARKER 1RAW(GAPDH tlr2) 2RAW(GAPDH tlr2)



2 MARKER TLR1(肺 1RAW 2RAW) GAPDH(肺 1RAW 2RAW).jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihegang2000

铁杆木虫 (正式写手)

你首先确定在这些组织中表达不
2楼2012-01-08 09:36:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

julietguo

银虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by lihegang2000 at 2012-01-08 09:36:37:
你首先确定在这些组织中表达不

我用来PCR的TLR是表达的呀,而且引物之前检测的也没问题呀
3楼2012-01-08 10:23:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

julietguo

银虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by lihegang2000 at 2012-01-08 09:36:37:
你首先确定在这些组织中表达不

我昨晚用IL-6和IL-4的引物检测了下我的cDNA,IL-6出来了,还挺亮的,我就奇怪了,这是不是说明我的RNA提的没问题,包括逆转也对的呀?
4楼2012-01-08 10:59:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihegang2000

铁杆木虫 (正式写手)

你是做半定量吧,是不是因为表达量太低了,你扩了多少个循环?
5楼2012-01-08 12:44:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

julietguo

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lihegang2000 at 2012-01-08 12:44:06:
你是做半定量吧,是不是因为表达量太低了,你扩了多少个循环?

可能是表达量太低了吧,我扩TLR和GAPDH时扩了30个循环,扩IL-4和IL-6时扩了40个循环~~可是也从胶图上看差好多呀,IL-6好亮呀

MARKER 肺(IL-6) 1RAW(IL-6) 2RAW(IL-6) 肺(IL-4) 1RAW(IL-4) 2RAW(IL-4)

6楼2012-01-09 08:45:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

frank213

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
julietguo(金币+2): 有帮助 2012-01-11 22:00:13
能不能看下你rrna的条带如何。提取完全吗
中庸不中道
7楼2012-01-09 18:32:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihegang2000

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
julietguo(金币+8): ★★★很有帮助 2012-01-11 22:00:01
引用回帖:
6楼: Originally posted by julietguo at 2012-01-09 08:45:04:
可能是表达量太低了吧,我扩TLR和GAPDH时扩了30个循环,扩IL-4和IL-6时扩了40个循环~~可是也从胶图上看差好多呀,IL-6好亮呀

MARKER 肺(IL-6) 1RAW ...

30个循环和40个循环相差可大了,亮度没有可比性吧
8楼2012-01-10 08:28:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

julietguo

银虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by frank213 at 2012-01-09 18:32:27:
能不能看下你rrna的条带如何。提取完全吗

我们实验室提过RNA后就直接逆转的,没有跑rRNA哎。。
9楼2012-01-10 09:15:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

julietguo

银虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by lihegang2000 at 2012-01-10 08:28:10:
30个循环和40个循环相差可大了,亮度没有可比性吧

哦,要不我用cDNA做个TLR的touchdown,再用IL-6做个阳性对照,如果TLR还不出来,那是不是就是引物问题啦?
10楼2012-01-10 09:22:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 julietguo 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-18 3/150 2026-03-18 22:35 by bingxueer79
[考研] 311求调剂 +4 冬十三 2026-03-18 4/200 2026-03-18 21:47 by 尽舜尧1
[考研] 321求调剂 +3 何润采123 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:27 by li123456789.
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 314求调剂 +8 无懈可击的巨人 2026-03-12 8/400 2026-03-18 14:50 by haxia
[考研] 311求调剂 +6 26研0 2026-03-15 6/300 2026-03-18 14:43 by haxia
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +4 材化逐梦人 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:22 by 007_lilei
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-13 6/300 2026-03-18 14:14 by 脱颖而出
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油!? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 招收0805(材料)调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生,2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
信息提示
请填处理意见