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pyflxxx新虫 (小有名气)
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[求助]
求教关于megalign和MEGA5实用细节问题。
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最近网上搜了些资料，可是都是笼统的教程。 实际应用过程中遇到些问题，真心求教！ 1关于DNASTAR的megalign，想做一个多序列间相似性%的图表，在加入我的样本序列进行align后，发现结果比对并不好，我的样本序列长短不一。本来只有左半边序列的样本，比对后也类似居中对齐了。这个怎么办？不是还要去头去尾吗？megalign里怎么去头去尾？ 试着用mega5align后保存的meg格式在dnastar里却打不开。 2关于mega5建树，想得到长短不一的有根树，可是当我cut off 70%以后，所有序列名称都对齐了，这个怎么办呢？ 另外我的bootstrap值设为10000，可是树里显示的值是100以内的，我看见有文献里有1000以内的，这是怎么回事呢。 谢谢 |
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