| 查看: 4882 | 回复: 9 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
lynchpku金虫 (正式写手)
|
[求助]
如何计算下面几个有机小分子的大小？
|
|||
|
本人对模拟完全是门外汉。呵呵。 现在课题需要计算几个分子结构。一个是油酸分子，一个是胆固醇分子。（下图附件）想知道它们的分子大小。 另外还想知道如果单纯一个烷基分子大概要多少个C原子的长度能够与这两个分子相当？ 最好能详细点的计算步骤，谢谢！  如果有大侠能算好，我将不胜感激。呵呵  |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 核壳催化剂2013-09-23 | 不错的帖子 |
» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有3人回复
-
明天应该可查了！？
已经有5人回复
-
如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》
已经有7人回复
-
没有任何消息-是不是就凉了
已经有8人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
人气不行了
已经有10人回复
-
我面上完蛋了
已经有10人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有24人回复
-
filecode，4个jtjc了
已经有17人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 想问下下面几个分子结构式怎么命名，俗名是什么？
已经有5人回复
- 两个分子极性大小比较
已经有12人回复
- 请教有机分子中O原子和H原子电荷数怎么计算，O-H键键级怎么计算！谢谢！
已经有4人回复
- 做的有机小分子晶体的XRD本身没有H,K,L值，要怎么算出其值？
已经有4人回复
- 【求助】帮忙算一个有机小分子的长度和宽度
已经有3人回复
- 【求助】帮忙算一个有机小分子的长度和宽度
已经有13人回复
- 【求助】问如何选择基组精确计算有机小分子结构和能量的问题
已经有5人回复
- 【求助】chemoffice中怎么看分子的大小和极性
已经有44人回复
- 【求助】环糊精对有机小分子包合的空间模拟怎么做
已经有12人回复
- 【求助】如何计算有机小分子的三重态能级（T1-S0）？
已经有12人回复
chf220284
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 5727.4
- 散金: 510
- 红花: 14
- 帖子: 1327
- 在线: 326.7小时
- 虫号: 428794
- 注册: 2007-08-04
- 专业: 药物化学
lynchpku4楼2011-12-22 11:45:44
lynchpku
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1063.6
- 散金: 1
- 帖子: 415
- 在线: 126.2小时
- 虫号: 310654
- 注册: 2006-12-24
- 性别: GG
- 专业: 生物医用高分子材料
2楼2011-12-21 10:48:48
chf220284
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 5727.4
- 散金: 510
- 红花: 14
- 帖子: 1327
- 在线: 326.7小时
- 虫号: 428794
- 注册: 2007-08-04
- 专业: 药物化学
3楼2011-12-22 11:23:34
yongleli
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 93 (初中生)
- 金币: 3769.1
- 散金: 369
- 红花: 24
- 帖子: 764
- 在线: 101.3小时
- 虫号: 303595
- 注册: 2006-12-03
- 专业: 原子和分子物理
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-22 20:40:01
lynchpku(金币+10): ★★★很有帮助 果然专家啊！不过确实不是很懂，还是要谢谢你。看来计算化学博大精深啊！ 2011-12-23 14:54:16
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-22 20:40:01
lynchpku(金币+10): ★★★很有帮助 果然专家啊！不过确实不是很懂，还是要谢谢你。看来计算化学博大精深啊！ 2011-12-23 14:54:16
|
用Gaussian03/09. 注意，这些分子比较大，最好先上网寻找相应的晶体结构pdb或者cif文件。 否则优化困难或者优化到不自然的结构去，算了体积也用处不大。 如果有pdb或者cif文件了，固定重原子简单 优化一下氢原子即可。或者用低精度方法简单优化一下。 然后加关键字 Volume 即可在输出文件中读出分子体积。 当然，如果对结果要求不高，直接拿pdf或者cif文件算一下也可。 |
5楼2011-12-22 19:58:52
20