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恶魔眼球

木虫 (小有名气)

[求助] pcr一直不出结果,可以从哪些方面调整

最近做pcr一直不出结果,只出现了引物二聚体,试过减少引物的量,减少酶量。。。还可以从哪些方面调整。PS:我们的反应体系是20uL的:ddwater 13.7uL,buffer 2.0uL,引物各1.0uL(10uM),dNTP0.8uL,Taq 酶0.5uL(2U/uL),模板1uL;反应过程:95° 5min,(94°  40s,58°  50s, 72°  50s)35cycles,72°  10min;目的条带是1200bp的,我们的引物Tm值一个是51.65,一个是56.06;退火温度试过55,56,58;曾在58°按照上述体系出来过结果一次,后来再没出来过。各位大虾,请指点迷津~~

marker 是DL2000

[ Last edited by 恶魔眼球 on 2011-12-17 at 15:22 ]
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蚊在江湖

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
温度梯度做开一点

可以在体系中加一点DMSO

换引物
9楼2011-12-19 11:43:56
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panda73

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-12-17 19:53:23
你的引物与模板配对区的Tm值是多少?(将你添加的酶切位点等非配对区先去掉)。而且,即使如你所说,你的退火温度应该调低到50度再试试。一般建议退火温度比Tm值低一些,当特异性不好时,才逐步提高退火温度
2楼2011-12-17 15:48:28
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Arrennew

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以使用降落PCR,从62度每个循环降1度,降到50度,再50度20个循环。
(还不行的话就反过来,上升,从45度升到58度,会跑出来很多带,挑你要的切胶回收,克隆。祝你成功)
生命不息,探索不止。
3楼2011-12-17 20:17:58
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
先摸索温度梯度。。。
一般经典的PCR体系基本都可以扩增出来的。。。
延伸时间2min即可。。。
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
4楼2011-12-18 20:03:58
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