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如何编写PBS作业的脚本？
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最近开始用Gaussian算个有机分子，但是不会编写PBS作业的脚本；我们学校的网站上倒是有一个简单的脚本示例，能不能帮我看看什么意思？具体代码有什么作用的？主要是红色部分不知道是什么意思，多谢了！ #!/bin/bash # #PBS -l nodes=2:compute:ppn=4,walltime=02:00:00 #PBS -q medium #PBS -N my_job_name # ########### INIT ########### # enable module tool source /lustrefs/apps/Modules/3.2.6/init/bash # load openmpi module add comp/path/31 mpi/openmpi-1.4/path31 # set workdir WORKDIR=/lustrefs/home/max/myapp/test1 ########### RUN ########### cd $WORKDIR #start application and log output using 'tee' in myapp_mpi.log mpirun /lustrefs/home/max/myapp/myapp_mpi [ ########### CLEAN UP ########### rm -rf *.tmp [ Last edited by undergoer on 2011-12-12 at 20:36 ] |
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恩，我之前代码比较简单，是我做的第一个计算，所以写的时候也就考虑了算这一个任务的情况； 看了你提供的代码，还是有点不太明白；首先我不太明白你说的这个Wrapper是怎么用的，这个我再查查资料多了解一下。 关于这个代码，你的代码中有一条 cp ${input}.gjf $TMP_DIR， 这个代码的功能在我原来写的那个里面似乎没有啊，原来的代码是g03 < $GJF.gjf > $GJF.out，我的gjf文件和我提交的job.sh是放在一个文件夹里，如果没有用到cp ${input}.gjf $TMP_DIR这一行代码，是不是也能照常运行？ 另外#export g03root=.....这一行代码以及下一行代码，是用来干什么的？定位Gaussian03程序的位置吗？那之前export PATH=/lustrefs/apps/Gaussian-03/bin:$PATH这个不能用来定义位置吗？ |
11楼2011-12-14 18:39:46
agent99
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2楼2011-12-13 08:16:46
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3楼2011-12-13 08:18:08
coolrainbow
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4楼2011-12-13 08:35:57
