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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 关于生物信息学方面，请教一个解决问题的方法
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davidck

金虫 (正式写手)

[求助] 关于生物信息学方面，请教一个解决问题的方法

1. 得到两株菌，具有某个性状方面的优势，他们之间存在一定的进化关系，但是没有出发菌株
2. 这两株菌都已经进行了全基因组测序，并且比对
3. 分析后无法找到近似的“野生型”菌株的基因序列
所以，也就是说只凭借这两株菌的全基因组信息，我怎么得到一些有利的结果，怎么分析出和这个性状相关的突变基因？
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1楼 2011-12-08 12:02:58
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匿名

用户注销 (正式写手)
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3楼2011-12-09 10:07:59
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davidck

金虫 (正式写手)
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2楼2011-12-09 09:28:55
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暧醉殇

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
scelab(金币+5): 鼓励新虫，谢谢交流哦~ 2011-12-09 14:24:05
是否已经得到了16SrRNA的序列，如果已经得到了就到GENBANK中去比对，找到和你这两株菌同源的菌，然后再查找GENBANK中的与你的菌同源的菌的相应特性，来分析你自己的菌就可以了。
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4楼2011-12-09 10:17:23
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davidck

金虫 (正式写手)
ls的办法都用过了，没办法找到那样的菌，最近似的经过比对后，差异也很多，没法进行有效分析
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5楼2011-12-13 16:40:47
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