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chchy2085

木虫 (正式写手)

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[求助] 有关生物信息学

大家好，已知一个蛋白的保守序列（当然全序列也知道，只是不同细菌的序列也不同），怎么样才能够在一个新的物种（基因组测序已完成）中查看是不是也有这个蛋白的同源蛋白啊？急，求，谢谢

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1楼 2011-12-06 22:13:30

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chchy2085

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引用回帖:

2楼: Originally posted by doublehelix at 2011-12-06 23:28:49:
先拿已知细菌序列进行相关基因全序列比对，若能与新物种某段序列相似性较高，则可初步判断为同源序列，接下来就需要实验来验证了。若比对不出，则可用保守序列进行比对，同样再经过实验验证即可。

可是物种的基因序列很大，在比对的过程中可能直接死机了，还有其他的方法么？谢谢！