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real339

金虫 (正式写手)

[求助] 原位杂交技术求助

各位战友:
     本人想做植物材料的原位杂交,但没有经验,想求一份详细的试验步骤,越详细越好,包括试剂的纯度要求,配制方法和保存方式,保存期限等。是在不知道怎么下手,先谢过了。如若需要本人愿意分享自己的一些经验,包括原核表达,农杆菌介导的转基因,以及基因克隆,载体构建,gene-walking,等方面。
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
西瓜(金币+4): 辛苦~ 2011-12-07 18:50:05
real339(金币+6): 谢谢啦。 2011-12-08 11:13:19
原位杂交操作流程
1. 压片,速冷揭去盖片,室温干燥1天然后-20℃保存备用。
2. 制片处理:滴加50-100µL 70%的甲酰胺(用2×SSC配置),盖上盖片。
80℃处理2min, 拿出后迅速甩掉盖片。迅速依次放到-20℃预冷的梯度酒精中(70%,95%,100%酒精各5min或以上)。
3. 处理完自然干燥。
4. 配置杂交体系:
去离子甲酰胺             7.5µL
20×SSC                            1.5µL
ssDNA(鲑鱼精DNA)     1.5µL
B-DNA(封阻)           1µL
50%DS(葡聚糖)                 3µL
Probe                                1µL
上述体系配置完成后,瞬时离心(闭光),然后80℃变性10min。变性完后,迅速放到冰上处理5min以上。
5.  把上述体系滴加到玻片上,盖片,然后周围涂上无色指甲油保温密封。放入
   37℃饭盒里反应8h以上或过夜。
6.  用镊子将指甲油剥掉,将标本片浸入2×SSC的染色缸中,轻轻摇动使盖片脱落。
7.  再按照下列步骤清洗:
2×SSC   室温       5min
2×SSC   42℃          10min
2×SSC   室温       5min
1×PBS   室温       5min
离心管中加入0.5-1%抗小牛血清(用1×PBS配置)100µL,再加入1µL Fab,斡旋混匀,滴加到盖片上(滴加时标本不要太干燥),盖上盖片,37℃条件下,45min或以上。
8.  按照步骤7清洗
9.  自然闭光干燥后滴加PI,盖上盖片镜检。

70%甲酰胺/2×SSC:
35mL甲酰胺,5mL 20×SSC,10mL水

2×SSC:
NaCl                       17.53g
柠檬酸三钠(带结晶水)     8.82g
定容至1000ml

10×PBS:
NaCl                    75.972g
Na2HPO4.12H2O          25.0698g
NaH2PO4.2H2O           4.6803g
定容至1000ml

以上是基因组原位杂交程序,如果你是利用分离的重复序列或者BAC作为探针的话那要根据需要确定是否加封阻DNA,探针标记可以购买,个人觉得罗氏的不错。
2楼2011-12-07 08:29:49
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


西瓜(金币+1): 牛人! 2011-12-07 18:50:29
你也可以到其他实验室去学习一下最好,南开大学宋文芹教授,南京农业大学陈佩度教授和王秀娥教授课题组,中国遗传与发育生物所的韩方普研究员课题组,四川农业大学任正隆教授课题组,郑有良教授课题组等,电子科技大学杨足君教授等课题组都做有在做FISH。其他课题组你可以再查询一下。
3楼2011-12-07 08:40:24
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