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lengfeng0210

铜虫 (初入文坛)

[求助] SNP标记与SSR标记

进行基因组选择时，由于使用SNP的条件不具备，请问如果选择SSR代替SNP，可行性怎么样？
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1楼2011-12-04 14:59:21
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★
zongyu_1986(金币+2): 感谢专家的热心解答 2011-12-04 20:38:53
lengfeng0210(金币+1): 多谢您的热心帮助！ 2011-12-04 23:19:22
引用回帖:
4楼: Originally posted by lengfeng0210 at 2011-12-04 20:00:19:
感谢您的热心解答，我想知道的是，如果用SSR做标记，能不能做到覆盖整个基因组、能不能达到很高的密度？

间隔5个cM之内，完全可以覆盖全基因组（根据我所研究的作物）
要想覆盖全基因组，全基因组测序是最理想的
赞一下(1人) 回复此楼
真相是最大的奢侈品
5楼2011-12-04 20:22:54
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qidannvzi

银虫 (正式写手)
引用回帖:
1楼: Originally posted by lengfeng0210 at 2011-12-04 14:59:21:
进行基因组选择时，由于使用SNP的条件不具备，请问如果选择SSR代替SNP，可行性怎么样？

没看明白，可能是我道行太浅了！
赞一下 回复此楼
准备跨新年！
2楼2011-12-04 15:56:50
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匿名

用户注销 (知名作家)

六界之外--大宇

优秀版主优秀版主
★ ★ ★
缺友情(金币+3): 辛苦大禹版！ 2011-12-04 21:14:36
本帖仅楼主可见
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3楼2011-12-04 16:53:39
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lengfeng0210

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zongyu_1986 at 2011-12-04 16:53:39:
你这个问题问的很迷糊，SSR这个方法本身没什么问题。SSR多态性好，属于共显性标记，其结果可以用于遗传多样性、群体遗传等很多方面，只是开发引物过程繁琐，而且价格昂贵。你如果想用的话肯定要有可靠的引物。

感谢您的热心解答，我想知道的是，如果用SSR做标记，能不能做到覆盖整个基因组、能不能达到很高的密度？
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4楼2011-12-04 20:00:19
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