24小时热门版块排行榜    

查看: 10174  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

allmessup

铜虫 (初入文坛)

[求助] 使用Pymol进行蛋白质分子结构的比较

请问诸位结构生物学的高手~~是不是可以用pymol将两个蛋白(同一family的)的某一个α-helix重叠以比较其他部分的差异呢~?

PS:我在coot上面实现了这个,但是把文件用pymol打开之后发现两个α-helix是平行的而没有重叠……好吧大囧~该怎么办呢。。。。?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

1号文摘

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

Ipsascientiapotestasest.
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by nnxqwei at 2011-12-15 12:31:32:
把将两个蛋白用pymol打开,先选择要重叠的不同α-helix并重新分别命名(如α-helix1和α-helix2),在右上角的α-helix1顶目中选A>align> to selection>α-helix2,就可以了吧!

楼主你的问题解决了吗!
4楼2011-12-17 09:11:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

dolphin100

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

DS, VMD 轻松实现
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
2楼2011-12-06 10:06:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wanhscn(金币+1): 不错,鼓励应助! 2011-12-17 09:46:53
把将两个蛋白用pymol打开,先选择要重叠的不同α-helix并重新分别命名(如α-helix1和α-helix2),在右上角的α-helix1顶目中选A>align> to selection>α-helix2,就可以了吧!
3楼2011-12-15 12:31:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

allmessup

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by nnxqwei at 2011-12-17 09:11:42:
楼主你的问题解决了吗!

还是不行。。。就是两个会并排排列而非完全重叠、、、、、、、、、、
Ipsascientiapotestasest.
5楼2011-12-17 19:24:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:13 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +5 gdd2018 2026-08-28 10/500 2026-08-29 14:10 by Jacob678
[基金申请] 面上意见出来了 +4 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 4/200 2026-08-29 14:06 by Jacob678
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 13:51 by jCd0dEvKHShX
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 13:41 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:29 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见