24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

piaoluodeyu

金虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 1242.6
红花: 2
帖子: 288
在线: 213.1小时
虫号: 1051343
注册: 2010-07-03
专业: 合成药物化学

[求助] gromacs 运行pdb2gmx中出错，pdb2gmx: error while loading shared libraries

刚开始学习gromacs，求指导啊！安装好后想运行tutor中的speptide例子，当pdb2gmx -f speptide.pdb -o speptide1.pdb -p speptide.top中出现
pdb2gmx: error while loading shared libraries: libmpi.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
希望大家不吝赐教谢谢！

回复此楼

» 猜你喜欢

依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。已经有10人回复
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗已经有9人回复
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福已经有11人回复
表哥与省会女结婚，父母去帮带孩子被省会女气回家生重病了已经有7人回复
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。已经有10人回复
天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人）已经有9人回复
有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车已经有10人回复
AI 太可怕了，写基金时，提出想法，直接生成的文字比自己想得深远，还有科学性已经有6人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

关于gromacs残基不识别的问题已经有17人回复
gromacs进行分子模拟时，pdb2gmx不认识小分子残基，怎么办，以及如何导入糖的力场已经有8人回复
GROMACS运行出错了，求助中已经有15人回复
GROMACS运行完后的结果分析已经有4人回复
gromacs4.6.5安装问题已经有4人回复
Amber 分子动力学求助！！！！已经有10人回复
gromacs中的top文件已经有16人回复
gromacs 添加新的力场pdb2gmx报错已经有5人回复
gromacs无法生成gro文件已经有5人回复
gromacs自己添加residue遇到的问题已经有6人回复
gromacs安装出错求助已经有4人回复
ssh端gromacs无法运行已经有5人回复
ms6.0 安装时候报错，error while loading shared libraries: libSM.so.6: 已经有7人回复
gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了? 已经有7人回复
Gromacs 4.5.5安装记录已经有5人回复
gromacs，用pdb文件生成top文件时遇到的问题已经有4人回复
gromacs运行出错，求方案，谢谢！！！已经有6人回复
在gromacs中运行mdrun命令时出错已经有10人回复
gmx不认小分子PDB残基怎么办？？已经有4人回复
[新手求教]安装Gromacs后，查看pdb2gmx命令，显示无此命令已经有9人回复
【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢已经有11人回复
【求助】gromacs的又一个问题已经有22人回复

1楼 2011-11-14 22:14:17

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zeozhou

木虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 3130.6
散金: 6
红花: 1
帖子: 158
在线: 60.5小时
虫号: 399283
注册: 2007-06-11
专业: 化学动力学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-11-23 19:09:58
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-11-23 19:10:06

类似于这种

LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/Compiler/11.1/073/lib/intel64:/opt/intel/impi/4.0.0.028/lib64:/opt/fftw/3.2.2-intel64/lib

export LD_LIBRARY_PATH

你要确定你安装intel的编辑器的lib目录是不是跟我的一样。