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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请问 能否在溶剂中只算过渡态单点能的情况下 把虚频消掉？
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ludeng8710

新虫 (小有名气)

[求助] 请问 能否在溶剂中只算过渡态单点能的情况下 把虚频消掉？

在气相中求得了过渡态
在溶剂中只想算下单点能，但会有一两个小虚频 查看结构 对应着苯环之类的转动
请问 可不可以
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1楼 2011-11-13 09:11:06
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangmt at 2011-11-13 17:59:50:
莫名其妙的问题
既然是在气相中得到的过渡态，那么也就是说你已经确认了，有且仅有一个虚频，而且振动模式正确。
然后在溶剂中只做单点算，既然只做单点算，那哪来的频率呢？你到底是在溶剂中重新优化了？重新找 ...

的确是单点算的同时做了频率分析，因为需要吉布斯自由能
现在是一方面需要溶液中过渡态的吉布斯自由能，一方面又没有时间在溶液中优化过渡态。。。
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3楼2011-11-13 18:06:23
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangmt at 2011-11-13 22:29:19:
一般情况下没必要在溶剂中寻找过渡态——虽然严格来说应该如此，但你也知道，溶剂化模型很粗糙。重新找的过渡态也未必就正确。
你做溶剂化计算时，结果自然会给出△Gsol，用气相的那个△G直接加上它就可以了啊。 ...

很感谢 那请问△Gsol这个值是直接在 溶剂的单点计算里就能找到么？怎么找？谢谢~
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5楼2011-11-14 10:22:20
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangmt at 2011-11-13 22:29:19:
一般情况下没必要在溶剂中寻找过渡态——虽然严格来说应该如此，但你也知道，溶剂化模型很粗糙。重新找的过渡态也未必就正确。
你做溶剂化计算时，结果自然会给出△Gsol，用气相的那个△G直接加上它就可以了啊。 ...

请问：我用scfvac关键词以后，在计算结果中会找到：
DeltaG (solv)    (kcal/mol) =   ＊＊＊     （溶剂化能）


溶剂中的自由能：自由能=单点能+自由能校正（来自于频率分析）+溶剂化能


这个“单点能”指的是算出来的SCF能量加上零点能校正么？
需要加零点能校正么？
【因为气相中过渡态的能量是直接提取的SCF(E)和Sum of electronic and thermal Free Energies（G）后面的数值】

这个“自由能校正（来自于频率分析）”指的什么呀？
谢谢~
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6楼2011-11-14 17:11:02
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangmt at 2011-11-13 22:29:19:
一般情况下没必要在溶剂中寻找过渡态——虽然严格来说应该如此，但你也知道，溶剂化模型很粗糙。重新找的过渡态也未必就正确。
你做溶剂化计算时，结果自然会给出△Gsol，用气相的那个△G直接加上它就可以了啊。 ...

没有金币了 麻烦大侠有空回答一下 以后送你花花....
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7楼2011-11-14 17:13:01
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by zhangmt at 2011-11-14 19:39:02:
楼上已经回答了，气相中作频率分析，得到的G用做过零点能校正后的值。
气相不做频率分析是得不到零点能校正的。
SCF得到的能量只是电子能，要加上平动能、转动能、振动能之后才得到内能E，也就是热力学上俗称的 ...

是不是气相的自由能+溶剂化能？
△G(g)+△G(solv)
△G(g) 用freq 得到, 也就是单点能+自由能校正,
△G(solv) 用scfvac 得到
谢谢~
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10楼2011-11-14 20:43:52
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangmt at 2011-11-13 22:29:19:
一般情况下没必要在溶剂中寻找过渡态——虽然严格来说应该如此，但你也知道，溶剂化模型很粗糙。重新找的过渡态也未必就正确。
你做溶剂化计算时，结果自然会给出△Gsol，用气相的那个△G直接加上它就可以了啊。 ...

我算出的△Gsol是正值，用气相的那个△G直接加上它那不就是液相中的能量要比气相中的高？这意味着什么呀？
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11楼2011-11-15 09:15:23
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by xiongb123456 at 2011-11-15 09:17:32:
受教了 最近就在算溶剂效应 也想找溶剂效应下的吉布斯自由能怎么算
看了很多文献 文献上好像也是说单点+自由能+溶剂化能
不过单点是不是就是Zero-point correction
而且气相结构的输出文件有三个校正系数
分 ...

我也不是很懂 还是等上面的高手吧
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13楼2011-11-15 10:46:44
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