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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 16rRNA序列酶切后，带型相同的菌株被确认在哪个分类水平了？
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churmi

银虫 (正式写手)

[求助] 16rRNA序列酶切后，带型相同的菌株被确认在哪个分类水平了？

如题啊

16rRNA序列酶切后，带型相同的菌株被确认在哪个分类水平了？

是属，目科，还是门纲的？谢谢
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1楼2011-11-10 10:11:24
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匿名

用户注销 (著名写手)
★
zhang8826857(金币+1): 鼓励应助 2011-11-11 08:35:01
本帖仅楼主可见
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2楼2011-11-11 02:55:27
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mingzhu392

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

带标准菌株一起酶切呀！
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3楼2011-11-13 09:21:48
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candice_fly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhang8826857(金币+5): 鼓励新虫 2011-11-14 15:52:49
你做酶切是为了分类？好像不行吧，应该是测序，序列提交NCBI才可以分类的，酶切条带相同，只是说明这两个片段是一个目的基因片段。类似于基因组文库，区分假阳性后，酶切，不同条带的送测，然后鉴定。这是我的个人理解，希望多交流
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4楼2011-11-14 11:34:35
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xinongfish

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

还是要测序的，酶切只是为了缩小比对范围，这样如果带型和你的对照菌株相同的话，可能目的性更强。
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5楼2011-11-14 15:31:26
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wangsongwei

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

酶切后确定相同与否，还是要测序的。测序后比对建立16s系统发育树即可
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6楼2011-11-30 10:20:45
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chenchuan24891

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhang8826857(金币+5): 鼓励新虫 2011-11-30 11:11:38
仅仅是酶切是不能对菌种进行分类的，酶切之后还得测序的，不是说作了酶切就行的，得出测序结果后，还行作个同源比对，这个比对有专门的软件，很方便和简单的。这样就能确定你的菌种哪个种属的，或者是不是新种，如是你就开心了。
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7楼2011-11-30 10:43:32
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vaivaiann

铜虫 (小有名气)
★
zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-12-28 11:48:36
我在做酶切  发现酶切结果和测序结果又一定的冲突。比如同一个酶切图谱包含几个属的细菌，同时同一个属的细菌又有几种酶切图谱。不知道各位有经验的同学有没有这种情况？鉴于这种情况的  我的数据没法往下分析了
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8楼2011-12-26 19:16:12
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vaivaiann

铜虫 (小有名气)
求帮助
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9楼2011-12-28 10:01:06
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20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

酶切只是为了缩小比对范围，这样如果带型和你的对照菌株相同的话，可能目的性更强。但最终还是要测序的
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但行好事，莫问前程
10楼2013-05-27 23:28:05
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