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zhllfly

铜虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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帖子: 134
在线: 26.3小时
虫号: 1029044
注册: 2010-05-26
性别: MM
专业: 食品科学基础

[求助] 构建系统发育树时，如何选择同源性序列？

亲爱的虫友们，给小妹帮帮忙，在构建系统发育树时，如何选择同源性序列？我想建树，将我的测序结果在NCBI里比对后，相似性很高的有很多，但不知道如何选择，应该选什么的序列进行建树？

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努力让自己变的优秀！

1楼 2011-11-07 11:32:40

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

千九胡杨

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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注册: 2010-03-31
专业: 微生物药物

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): good 2011-11-07 18:52:07
zhllfly(金币+1): 谢谢你我的是真菌曲霉不知道用相同的方法可不可以 2011-11-07 21:47:48

我之前做过原核的系统发育分析如果是原核微生物的话结合LPSN网站的模式菌株找到blast里相似度高而且是模式菌株的菌株序列进行同源序列分析至少找到10株以上用软件进行系统发育树构建

赞一下(1人)

感谢天鹅绒般温暖厚实的感情

2楼2011-11-07 16:33:00

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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