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zhllfly

铜虫 (小有名气)

[求助] 构建系统发育树时,如何选择同源性序列?

亲爱的虫友们,给小妹帮帮忙,在构建系统发育树时,如何选择同源性序列?我想建树,将我的测序结果在NCBI里比对后,相似性很高的有很多,但不知道如何选择,应该选什么的序列进行建树?
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千九胡杨

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): good 2011-11-07 18:52:07
zhllfly(金币+1): 谢谢你 我的是真菌 曲霉 不知道用相同的方法可不可以 2011-11-07 21:47:48
我之前做过原核的系统发育分析  如果是原核微生物的话 结合LPSN网站的模式菌株 找到blast里相似度高而且是模式菌株的菌株序列进行同源序列分析 至少找到10株以上 用软件进行系统发育树构建
感谢天鹅绒般温暖厚实的感情
2楼2011-11-07 16:33:00
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