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求高手解救荧光定量的问题
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最近最荧光定量试验,一直很不顺,用的是bioer的试剂,IQ5的机器。做的是miRNA的相对定量表达,用的是∆∆CT法,所扩增的片段有点大,但在200bp之内,出现很奇怪的现象,附上图: 扩增曲线: 溶解曲线: 很是疑惑为什么前面的曲线不平,应该不是机器的问题,因为其他人做没有出现这样的现象,我把浓度给变大10倍也没有很好的改观,求高手指教,非常感谢! 扩增曲线 溶解曲线 溶解曲线的倒数图 |
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西瓜
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【答案】应助回帖
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wanhscn(金币+2): 鼓励应助! 2011-11-06 08:16:04
小橘子~(金币+1): 非常感谢你认真的分析和建议 2011-11-06 10:04:03
wanhscn(金币+2): 鼓励应助! 2011-11-06 08:16:04
小橘子~(金币+1): 非常感谢你认真的分析和建议 2011-11-06 10:04:03
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你说的“前面的曲线不平”是什么意思? 从你的扩增曲线来看,是模板浓度太低了。按照2的N次方扩增,模板浓度大10被,Ct值只变小3,10倍还是不够的。一般情况下,15~20个循环左右扩增曲线起来比较合适。 你的部分样品35个循环后才有扩增,有点夸张……因为一般认为,阴性对照35个循环之前没有扩增是正常的…… 虽然这样子也能定量,但是这么多循环才有扩增,有可能是非特异的扩增了,还是想办法加大模板浓度吧。反转录的时候多加些RNA,可以取试剂盒推荐的RNA用量的上限。 从融解曲线来看,扩增还是比较特异的。你的特异的峰有高有低,是因为PCR产物还没达到饱和(从扩展曲线看,离平台期还远呢)。 综上,主要的问题,还是模板浓度过低。好在,扩增的特异性不错。 |
2楼2011-11-06 00:02:40
3楼2011-11-23 10:40:04
4楼2011-11-24 00:20:34
shaquila
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5楼2011-11-24 11:37:57
q307078056
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