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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 新手求助！~~~如何使用DS模拟蛋白-蛋白接合？
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ziecoe

铜虫 (小有名气)

[求助] 新手求助！~~~如何使用DS模拟蛋白-蛋白接合？

Accelrys.Discovery.Studio.v2.5.Windows 版，如何进行蛋白-蛋白接合模拟呢？请高手给出具体操作，小弟是纯纯的小白。。
DS是不是可以通过接合功能来预测两个蛋白接合的可能性呢？（不清楚这2个蛋白是否会互相作用）
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1楼 2011-11-03 21:57:12
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davesong

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-11-04 22:09:50
zcock could solve your question
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2楼2011-11-04 08:30:59
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ziecoe

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
1楼: Originally posted by ziecoe at 2011-11-03 21:57:12:
Accelrys.Discovery.Studio.v2.5.Windows 版，如何进行蛋白-蛋白接合模拟呢？请高手给出具体操作，小弟是纯纯的小白。。
DS是不是可以通过接合功能来预测两个蛋白接合的可能性呢？（不清楚这2个蛋白是否会互相作 ...

求DS中ZDOCK模块具体参数设置及大概解释？
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3楼2011-11-07 23:53:30
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-08 22:02:48
看看DS上面的Zdock的介绍一切OK的啊。要自己多找找教程看看。
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
4楼2011-11-08 14:00:00
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ziecoe

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ts2009 at 2011-11-08 14:00:00:
看看DS上面的Zdock的介绍一切OK的啊。要自己多找找教程看看。

我看了教程啊，关键问题是有些和默认设置不一样，我怎么知道我的蛋白应该应用那些参数呢？
还是说一切默认就OK？
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5楼2011-11-08 16:27:45
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-11-08 22:03:25
ziecoe(金币+1): 2011-11-08 22:43:09
引用回帖:
5楼: Originally posted by ziecoe at 2011-11-08 16:27:45:
我看了教程啊，关键问题是有些和默认设置不一样，我怎么知道我的蛋白应该应用那些参数呢？
还是说一切默认就OK？

先用默认的跑下就OK了，一般默认的参数设置针对很多常见的体系做的，所以可以先用默认的参数跑下，不行的话可以参看DS关于Zdock的教程作适当的修正。不同的人做不同的体系参数也许有不同，所以还是针对自己的需要静下心好好看看教程，这个很重要
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
6楼2011-11-08 18:10:44
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ziecoe

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by ziecoe at 2011-11-08 16:27:45:
我看了教程啊，关键问题是有些和默认设置不一样，我怎么知道我的蛋白应该应用那些参数呢？
还是说一切默认就OK？

能不能分享个教程？十分感谢
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7楼2011-11-08 22:42:35
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民
★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-11-09 20:35:46
给你传个中文版的吧，你自己好好看看，希望有用。祝好运，多交流
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
8楼2011-11-09 10:37:34
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雷童子

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by ts2009 at 2011-11-09 10:37:34
给你传个中文版的吧，你自己好好看看，希望有用。祝好运，多交流

亲，能不能也帮我传一份中文版的教程
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一件件小事，一样样弄懂
9楼2016-01-26 09:53:34
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