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omit的范围如何选择 Most Disagreeable Reflections
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结构精修时经常有一些所谓的“坏点”需要人工删掉 是不是一般在lst文件的Most Disagreeable Reflections 部分来看呢，选择要删掉的标准看什么，知道的兄弟姐妹们帮忙看看啊！！！指导一下啊！！ Most Disagreeable Reflections (* if suppressed or used for Rfree) h k l Fo^2 Fc^2 Delta(F^2)/esd Fc/Fc(max) Resolution(A) -2 0 2 64037.14 50644.90 7.43 0.476 7.86 -5 1 4 94153.03 81477.94 4.78 0.604 3.45 -1 1 1 124651.48 109571.69 4.43 0.700 9.00 1 1 1 51261.99 44949.42 4.19 0.448 7.01 -6 0 6 75893.59 66173.30 3.98 0.544 2.62 6 2 2 10339.01 12022.42 3.32 0.232 2.19 1 5 0 100621.81 91339.66 3.26 0.639 2.18 -4 0 8 95520.95 85387.83 3.18 0.618 2.02 8 12 1 3263.82 1782.18 3.18 0.089 0.84 -3 1 3 54399.81 49317.77 3.15 0.470 4.73 1 1 0 33053.59 30010.49 3.11 0.366 9.42 -4 0 2 45854.87 41263.16 3.08 0.430 5.27 |
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huahua1216(金币+1):谢谢参与
lijunjie84(金币+1, CMEI+1): 谢谢回帖交流 2011-12-31 11:45:16
huahua1216(金币+4): 2011-12-31 11:47:48
huahua1216(金币+1):谢谢参与
lijunjie84(金币+1, CMEI+1): 谢谢回帖交流 2011-12-31 11:45:16
huahua1216(金币+4): 2011-12-31 11:47:48
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关于坏点的删除： 所谓的坏点，我的理解就是“most disagreeable reflections”，即|Fo|^2 和|Fc|^2 差别很大的点。这样的点在结构修正的最后阶段能否删除呢？这里引用shelx97手册里的一句原文： In the final refinement ALL DATA should be used except for reflections known to suffer from systematic error (i.e. in the final refinement the OMIT instruction may be used to omit specific reflections - although not without good reason - but not ALL reflections below a given threshold). Anyone planning to ignore this advice should read Hirshfeld & Rabinovich (1973) and Arnberg, Hovmöller & Westman (1979) first. 由此看来，修正的最后阶段删除一些坏点是可以的。尤其是在结构模型已经十分完美，几乎没有发生错误的可能的前提下，删除坏点不但可以降低R值，还可以提高结构参数本身的精度。 产生这些坏点，即造成Fo 和Fc不一致的原因有很多，下面列举几个我能想得到的原因： 1. 低角度的衍射点， 由于beam stopper 的遮挡，造成观测强度明显降低. 这是楼上的各位建议删除低指标的衍射的原因之一。因为低指标的衍射都是靠近倒易点阵原点，衍射角度很低的。 2. 探测器饱和， 造成观测强度误差很大。这种原因造成的强度误差很大程度决定于结构。另外一方面，低角度的衍射点往往很强，容易饱和。 3. 探测器有坏点。导致观测强度记录偏低。 4. 高角度的衍射点太弱。造成测量不准确。这是楼上各位建议根据 Delta(F^2)/esd 的值删除某些弱点的原因。至于具体的数值，需要具体结构具体分析。我也见过Delta(F^2)/esd>6的点删除的。 5. 由于晶体结构本身的原因，比如孪晶造成的衍射点不可能有准确的观测值。如果发现坏点有一个普遍的趋势，就是Fo 都明显大于Fc，这是一个很好的孪晶标志。因为孪晶里面有至少两套倒易点阵。有些点完全重合，有些点部分重合，准确的观测都不大可能。 其他原因暂时还没想到，换衣大家都来讨论。 |
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10块钱10楼2011-12-31 11:43:21
2楼2011-10-31 11:09:05
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2011-10-31 13:57
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huahua1216(金币+1):谢谢参与
dlyan6楼
2011-10-31 14:16
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huahua1216(金币+1):谢谢参与
