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380218013

金虫 (小有名气)

[求助] 质粒测序结果分析

小弟构建质粒测序结果序列比对如图,发现中间多出一段序列!请教可能原因,以及解决方案!谢谢!
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dog_608582

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): 鼓励交流! 2011-11-02 14:22:50
你是不是要用CDNA去做表达,多出来得可能是你的样品本身mRNA没有完成去除内含子的过程,因此你和基因比对的时候多出一段序列。如果是这样,你需要重新在该基因表达的时候提取RNA,然后扩增。另外一种可能就是本身基因多出了序列,你只要把基因翻译成蛋白,如果翻译不出问题,得到类似的结果域,那么可能就是NCBI上得序列有问题。不要太迷信NCBI上得数据,有些也有错误。
分享快乐,快乐分享
8楼2011-11-02 09:51:04
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zhfge

铜虫 (初入文坛)

稍微描述一下你的实验过程?
2楼2011-10-29 16:21:47
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xiaohaozi9876

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): good 2011-11-01 17:58:55
很有可能是database上的数据有误

一般出现这种情况的话,比较一下其他的sample,若一致,则没有问题,大可放心接下去做实验
Onceinamoment,wethinkoneselfgrowup,oneday,wefinallyfound...
3楼2011-10-31 16:02:18
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380218013

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaohaozi9876 at 2011-10-31 16:02:18:
很有可能是database上的数据有误

一般出现这种情况的话,比较一下其他的sample,若一致,则没有问题,大可放心接下去做实验

我做的是表达质粒 多一个碱基都不可以的   我在NCBI上也BLAST过的。可能原因是T载体上有一段有相应的酶切位点 多切了50个碱基左右的序列
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4楼2011-11-01 15:38:10
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