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380218013

金虫 (小有名气)

[求助] 质粒测序结果分析

小弟构建质粒测序结果序列比对如图，发现中间多出一段序列！请教可能原因，以及解决方案！谢谢！
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好好生活，努力赚钱
1楼 2011-10-27 15:19:20
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dog_608582

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): 鼓励交流！ 2011-11-02 14:22:50
你是不是要用CDNA去做表达，多出来得可能是你的样品本身mRNA没有完成去除内含子的过程，因此你和基因比对的时候多出一段序列。如果是这样，你需要重新在该基因表达的时候提取RNA，然后扩增。另外一种可能就是本身基因多出了序列，你只要把基因翻译成蛋白，如果翻译不出问题，得到类似的结果域，那么可能就是NCBI上得序列有问题。不要太迷信NCBI上得数据，有些也有错误。
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8楼2011-11-02 09:51:04
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zhfge

铜虫 (初入文坛)
稍微描述一下你的实验过程？
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2楼2011-10-29 16:21:47
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xiaohaozi9876

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): good 2011-11-01 17:58:55
很有可能是database上的数据有误

一般出现这种情况的话，比较一下其他的sample，若一致，则没有问题，大可放心接下去做实验
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Onceinamoment,wethinkoneselfgrowup,oneday,wefinallyfound...
3楼2011-10-31 16:02:18
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380218013

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaohaozi9876 at 2011-10-31 16:02:18:
很有可能是database上的数据有误

一般出现这种情况的话，比较一下其他的sample，若一致，则没有问题，大可放心接下去做实验

我做的是表达质粒 多一个碱基都不可以的   我在NCBI上也BLAST过的。可能原因是T载体上有一段有相应的酶切位点 多切了50个碱基左右的序列
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好好生活，努力赚钱
4楼2011-11-01 15:38:10
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