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txyamy

木虫 (小有名气)

[求助] 蛋白氨基酸序列分析及二、三、四级结构的鉴定

RT,本人想分离纯化蛋白,然后对其纯蛋白进行氨基酸序列分析及二、三、四级结构的鉴定, 想请教下高人,这个纯蛋白进行氨基酸序列分析用MADI-TOF质谱仪可以分析吗?还是需要送样,以及主要的测序公司怎么找呢? 另外蛋白分离纯化过程中,已经变性,接下来的结构还有希望吗?请高人指点。 不胜感激啊!
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

质谱可以用于研究蛋白质的四级结构和蛋白质-蛋白质相互作用,要用MADLI-MS,能够在质谱峰上出现特异性的蛋白质的四级结构和蛋白质-蛋白质相互作用的峰,解离状态或者单个亚基没有此峰。

文献可见:
MIE Vol-402 Biological Mass Spectrometry(2005,)Free,论坛附件上传,下载快。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5880521
25楼2013-06-08 17:58:43
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txyamy

木虫 (小有名气)

怎么都木有人回复下呢!自己做板凳啦~期待大家过来交流 给俺点灵感呀~~
2楼2011-10-26 21:35:30
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zhengfan1109

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流,祝顺利! 2011-10-27 09:31:13
txyamy(金币+10): 谢谢啊,那请问下,您说的二级结构N端蛋白测序是Edam降解,那调取基因是仪器可以一次性完成,还是要自己再做,不懂,别拍砖啊,呵呵 2011-10-27 11:05:29
二级结构可以通过N端蛋白测序,调取基因,基因测序,获得相应基因序列,从而得到蛋白序列信息。
三级结构:X 射线晶体衍射分析。
3楼2011-10-26 22:33:35
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chris9981

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流~祝顺利! 2011-10-27 09:31:42
txyamy(金币+10): 是测蛋白各级结构 一级结构,就是氨基酸序列?????????用MADI-TOF-MS/MS是吗? 2011-10-27 11:30:49
单纯的TOF不能解析蛋白质的氨基酸序列,需
要用氨基酸序列分析仪,或者二级MS也有可能。
4楼2011-10-27 08:19:44
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