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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 构建系统发育树 序列剪切
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lgn20118049

金虫 (小有名气)

[求助] 构建系统发育树 序列剪切

用MEGA 4构建系统发育树，因为我测的是半序即单链，但是在BLAST上很多菌都是全序的，如果单是用MEGA 4剪切，构建的发育树很乱。请问大家是如何剪切的啊？
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1楼 2011-10-23 15:24:04
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tineidae

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): Good！ 2011-11-17 18:54:32
lgn20118049(金币+10): 2011-11-18 12:25:18
用CLUSTALx或MUSCLE先ALIGNMENT，然后就可以在MEG中剪切了。MEG 4中也自带了CLUSTAL
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3楼2011-11-17 07:05:44
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lgn20118049

金虫 (小有名气)
我的序列的长度大约550bp,但是BLAST上一般都是1400-1500bp，不知如何剪切
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2楼2011-10-23 15:27:16
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