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lgn20118049

金虫 (小有名气)

[求助] 构建系统发育树 序列剪切

用MEGA 4构建系统发育树,因为我测的是半序即单链,但是在BLAST上很多菌都是全序的,如果单是用MEGA 4剪切,构建的发育树很乱。请问大家是如何剪切的啊?
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lgn20118049

金虫 (小有名气)

我的序列的长度大约550bp,但是BLAST上一般都是1400-1500bp,不知如何剪切
2楼2011-10-23 15:27:16
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tineidae

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): Good! 2011-11-17 18:54:32
lgn20118049(金币+10): 2011-11-18 12:25:18
用CLUSTALx或MUSCLE先ALIGNMENT,然后就可以在MEG中剪切了。MEG 4中也自带了CLUSTAL
3楼2011-11-17 07:05:44
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