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wxy0601

新虫 (初入文坛)

[求助] 跪求高手求助,急急急,细菌提取DNA 问题

最近一直在做菌株鉴定试验,自己提的DNA ,跑电泳条带很亮,做PCR跑电泳也有条带,可是宋测序公司回来的结果很奇怪,接连几次送的样出来的序列都是一样的,但是样品本来是有球菌有杆菌的,后来拿水做对照,也能批出来,引物,水,buffer都跑过电泳了,上游引物出了一次条带,再做又没有条带了,很奇怪,到底是哪有问题呢,郁闷了好久了,哪位高手帮忙解决一下?
今天用天根的细菌DNA提取试剂盒体DNA ,跑电泳只出来2个,(一共做了9个),之前我不小心把试剂盒放冰箱了(-20)会不会低温影响了提取效果啊?泪求解答!!!!!!!!
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
西瓜(金币+4, MolEPI-1): Good! 2011-10-19 18:42:09
西瓜(MolEPI+1): 操作失误,对不起啊! 2011-10-20 10:08:22
西瓜(MolEPI+1): 补上 2011-10-20 10:08:32
拿水做对照,也能批出来说明你的其中一个试剂污染了,因为只要极少量的污染就可以导致这样的结果,水,buffer都跑电泳了没有条带不弄说明没有污染,量少跑不出来的。建议把所有试剂包括水换掉试试。
2楼2011-10-19 07:55:05
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NDA提取

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

西瓜: 本版是不允许发广告的,这次先提醒,下次就要扣金币了哦 2011-11-17 19:11:48
有机会可以用下俺家高通量组织研磨器. 可以在DNA RNA提取过程中代替液氮手动研磨, 只需把物料和研磨球加入1.5/2ml离心管中,离心管放入我们提供的耐低温适配器上,把适配器和夹具放入液氮中,冷冻3-5分钟,取出,加裂解液(也可不加),即可进行研磨。每台研磨仪配2个适配器,每个适配器可以放的1.5/2ml离心管的数量是24个,这样2个适配器同时工作, 即可一次研磨48个样品,这些样品的研磨在2-3min内即可研磨完成,时间短,效率高。
高通量组织研磨仪-DNA/RNA提取利器!
3楼2011-11-17 15:21:09
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longrna

新虫 (正式写手)

这句话是什么意思啊?“引物,水,buffer都跑过电泳了,上游引物出了一次条带,再做又没有条带了”
怎么引物、水、buffer都跑电泳去了?
伟大航线....
4楼2011-11-17 18:04:31
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flyme8373

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对啊    电泳检测的灵敏度很低的   没有条带不代表没有DNA的   很可能是试剂污染了
惠泽天下 尔我同行
5楼2012-04-05 10:41:02
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hyacinth326

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+2, 鼓励交流~最近很活跃啊 2012-04-05 18:27:35
遇到这种问题,最好的办法就是把所有的试剂都换一下,与其一个一个的排出原因还不如直接换了,不浪费时间。。。做菌株鉴定,不管gram positive还是gram negative的只要是提出一点基因组DNA就没有问题,一般的试剂盒都行,手提也可以,我们提单菌的有时候就根本不用溶菌酶处理,而是直接离心菌体,煮沸,然后去蛋白什么的,一点问题都没有~~
6楼2012-04-05 11:09:11
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