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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 提取土壤DNA，如何去除腐殖质等PCR抑制物？
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匿名

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1楼 2011-10-18 14:58:54
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HarveyWang

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海外行者
★
zhang8826857(金币+1): 鼓励一下^_^ 2011-10-18 17:20:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by lilylee61 at 2011-10-18 16:11:22:
0.9% NaCl 灭菌水 是用于清除腐殖质的吗？

用于悬浮和沉淀菌体。。。。腐殖质的大部分都可以选择性地在上清（可溶性部分）或与土壤共沉与沉淀中（残枝败叶）。
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【我一直认为做土匪很性感很坏，很直接，可以大声喊：JCMM我爱你！所以，我自从博士毕业后，就一直在寻找黑道大哥一起去抢钱、抢粮、抢地盘】
4楼2011-10-18 16:37:36
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HarveyWang

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海外行者

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
wolfebst(金币+3): 鼓励 2011-10-18 16:28:50
wolfebst(金币+3): 鼓励 2011-10-18 16:28:52
lilylee61(金币+1): 你提供的方法我有待验证，希望有用。多谢你的指教。 2011-10-19 19:54:39
很简单。。

1）在进行上述操作之前，将土壤样品在 0.9% NaCl 灭菌水中混匀2-5 min（1g 土壤/5-10mL），然后高速离心10000 rpm X 5min，使土壤颗粒和菌体或菌丝沉淀。

2）倒掉离心上清！将沉淀用1-3 mL 0.9% NaCl 灭菌水重悬，冰浴中静置1-2分钟使土壤颗粒自然沉淀。

3）取浑浊的上层液1-2 mL，高速离心10000 rpm X 5-10min。倒掉离心上清！沉淀再按比例加入DNA提取缓冲液和石英砂等，进行提取工作（这个比例得根据你自己的土壤样品摸索下咯）。
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【我一直认为做土匪很性感很坏，很直接，可以大声喊：JCMM我爱你！所以，我自从博士毕业后，就一直在寻找黑道大哥一起去抢钱、抢粮、抢地盘】
2楼2011-10-18 16:00:24
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匿名

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3楼2011-10-18 16:11:22
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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by HarveyWang at 2011-10-18 16:00:24:
很简单。。

1）在进行上述操作之前，将土壤样品在 0.9% NaCl 灭菌水中混匀2-5 min（1g 土壤/5-10mL），然后高速离心10000 rpm X 5min，使土壤颗粒和菌体或菌丝沉淀。

2）倒掉离心上清！将沉淀用1-3 mL 0.9% ...

您好！
目前我看到的关于这方面土壤DNA 提取 腐植酸去除 是个很大的难题 你这个办法不知道你亲自用过没？ 另外，如果分离菌体跟腐殖质效果好的话，那一般做土壤DNA的 一般是做微生物多样性的 这样的方法损失率该有多大呢？
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5楼2011-10-18 18:11:55
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