应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 序列上传网站
51/1返回列表
查看: 678  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

eereer

新虫 (初入文坛)

[求助] 序列上传网站

求助：
    请问除了NCBI还有其他网站可以上传基因序列吗？
    相似度低于95%的序列，NCBI不接受怎么办？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-10-17 16:28:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

billowzeng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
1楼: Originally posted by eereer at 2011-10-17 16:28:05:
求助：
    请问除了NCBI还有其他网站可以上传基因序列吗？
    相似度低于95%的序列，NCBI不接受怎么办？

我也想知道这个问题呀，有其他网站（欧洲或日本都有一个数据库），不知道怎样提交。
赞一下 回复此楼
2楼2011-10-21 12:08:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yitiandeng

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

直接在NVBI下载一个批量也可以用于单条上传数据的软件sequin，打开里面有好几个数据库的选择，欧洲的和日本的都有，NCBI不接收？不可能吧
赞一下 回复此楼
3楼2011-10-21 21:57:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

闲花落地

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

eereer(金币+12): 谢谢 2011-10-24 12:05:17
我比较熟悉NCBI的序列上传。建议先通过NCBI的Blast软件进行比对，至少确定该序列所属的属。可到NCBI网站是直接上传该序列，不过需要把序列保存成Fasta格式，并且在前面加上一些内容，如“>Seq1 [organism=Monascus sp.] Monascus sp. Strain M 18S rRNA gene, partial CDS”，后续按照提示一步一步填写。也可以采用Sequin软件上传。
其他的数据EMBL和DDBJ应该也有相关的上传序列的方式。
赞一下 回复此楼
4楼2011-10-24 09:54:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guye1

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2929962楼: Originally posted by 闲花落地 at 2011-10-24 09:54:31
我比较熟悉NCBI的序列上传。建议先通过NCBI的Blast软件进行比对，至少确定该序列所属的属。可到NCBI网站是直接上传该序列，不过需要把序列保存成Fasta格式，并且在前面加上一些内容，如“>Seq1  Monascus sp. St ...

你好，请问上传的序列是原始序列还是比对剪切后的序列，但是我的序列比对剪切后有一些序列完全相同了怎么办？
赞一下 回复此楼
水木年华
5楼2012-10-11 07:34:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 eereer 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 6/300 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +23 医学老男孩 2026-08-13 49/2450 2026-08-14 20:02 by zhaifei
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +5 Ldrop2023 2026-08-13 5/250 2026-08-14 18:48 by ssxclkj
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] 好奇怪的filecode +6 布布和一二 2026-08-08 7/350 2026-08-14 13:38 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +10 Tide man 2026-08-10 11/550 2026-08-14 10:30 by 沁言学术
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭