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faile18

金虫 (小有名气)

[求助] 求帮忙分析下菌液PCR检测结果

各位同志,图是我挑选单克隆之后菌液PCR的结果,上半部分为一个基因大小2168bp,下半部分基因大小1527bp。从图上看,只有基因2只有2.5可能有目的条带,基因6中6.2.1-6.2.5均有1500bp左右片段,但亮度不够。最近的单克隆经常出现这种情况,要么亮度不够,要么不是目的条带,请各位大侠帮忙分析下出现这种情况的原因及可能的解决办法,不胜感激。
ps:连接的目的基因是通过PCR扩增、切胶回收得到,连接前电泳检测过,条带单一。
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qj900302

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2282128楼: Originally posted by bioartist at 2011-10-08 22:03:39
我之前探讨过类似的问题了,今天在小议一下:

1. 楼主的问题说的不是很清楚。用的是什么载体?菌液PCR是如何选用引物的?退火温度是怎么选择的?
   这种电泳结果说明,你的引物特异性不是很高,引物可能在转化 ...

我是新手 想问一下怎么样裂解菌体成为模板啊?
19楼2012-09-28 22:42:05
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wen19870427

新虫 (初入文坛)

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西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-10-08 21:29:45
检测基因6用的引物不够特异,重新设计引物
2楼2011-10-08 20:48:03
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aayqaa

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

情况比较复杂,干脆提下质粒重新p下好了
3楼2011-10-08 21:12:01
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双鱼猫咪

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): good 2011-10-09 07:57:33
请问检测的用的是特异引物还是通用引物,如果是通用引物,P出来的片段会比目的片段稍大一点。菌液PCR本身假阳性就很高,最好用质粒PCR,结合酶切鉴定,会使成功率提高
5楼2011-10-08 21:55:48
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