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thelrgbird金虫 (小有名气)
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[求助]
算DOS时出错
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请求各位高手帮助： 本人在计算DOS的时候出错，而且出错出的很让人恼火…… 其中的log文件时这样的： Job started at: Tue Oct 4 19:50:21 CST 2011 yhrun: error: cn180: task 12: Killed yhrun: error: cn179: task 0: Killed yhrun: error: cn179: task 11: Killed yhrun: error: cn181: task 24: Killed yhrun: error: cn180: task 23: Killed yhrun: error: cn181: task 35: Killed yhrun: error: cn180: task 22: Killed yhrun: error: cn179: task 10: Killed yhrun: error: cn179: task 1: Killed yhrun: error: cn181: task 25: Killed yhrun: error: cn180: task 13: Killed yhrun: error: cn179: task 8: Killed yhrun: error: cn181: task 34: Killed yhrun: error: cn180: task 21: Killed yhrun: error: cn179: task 2: Killed yhrun: error: cn181: task 28: Killed yhrun: error: cn180: task 15: Killed yhrun: error: cn181: task 27: Killed yhrun: error: cn179: task 3: Killed yhrun: error: cn180: task 17: Killed yhrun: error: cn181: task 29: Killed yhrun: error: cn179: task 4: Killed yhrun: error: cn180: task 18: Killed yhrun: error: cn179: task 5: Killed yhrun: error: cn181: task 30: Killed yhrun: First task exited 60s ago yhrun: tasks 6-7,9,14,16,19-20,26,31-33: running yhrun: tasks 0-5,8,10-13,15,17-18,21-25,27-30,34-35: exited abnormally yhrun: Terminating job step 22332.0 yhrun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish. slurmd[cn179]: *** STEP 22332.0 KILLED AT 2011-10-04T19:51:53 WITH SIGNAL 9 *** slurmd[cn179]: *** STEP 22332.0 KILLED AT 2011-10-04T19:51:53 WITH SIGNAL 9 *** slurmd[cn181]: *** STEP 22332.0 KILLED AT 2011-10-04T19:51:53 WITH SIGNAL 9 *** slurmd[cn181]: *** STEP 22332.0 KILLED AT 2011-10-04T19:51:53 WITH SIGNAL 9 *** slurmd[cn180]: *** STEP 22332.0 KILLED AT 2011-10-04T19:51:53 WITH SIGNAL 9 *** slurmd[cn180]: *** STEP 22332.0 KILLED AT 2011-10-04T19:51:53 WITH SIGNAL 9 *** Job finished at: Tue Oct 4 19:51:54 CST 2011 我用的是天河1A大系统机型运算的，不知道有没有人在这上面进行计算也出现了类似的错误，很郁闷阿…… 我的KPOINTS 设为15 * 15 * 15的 INCAR为： SYSTEM=Ni2P Startparameter for this run: NWRITE = 2 write-flag & timer PREC = high ISTART = 1 job : 0-new 1-cont 2-samecut ICHARG = 11 charge: 1-file 2-atom 10-const ISPIN = 2 spin polarized calculation? INIWAV = 1 electr: 0-lowe 1-rand 2-diag VOSKOWN = 0 pp: 0-PBE 1-PW91 Electronic Relaxation 1 ENCUT = 400 run the run_encut.sh, found a good velue NELM = 200; NELMIN= 8; NELMDL= 8 # of ELM steps EDIFF = 1E-05 stopping-criterion for ELM LREAL = A real-space projection Ionic relaxation NFREE = 10 IWAVPR = 11 prediction: 0-non 1-charg 2-wave 3-comb LCORR = T Harris-Foulkes like correction to forces POTIM = 0.50 time-step for ionic-motion NBLOCK = 1 DOS related values: ISMEAR = 1; SIGMA = 0.20 broadening in eV -4-tet -1-fermi 0-gau s EMIN = -10.00; EMAX = 10.00 NEDOS = 3000 Electronic relaxation 2 (details) IALGO = 48 algorithm ALGO = Fast LDIAG = T sub-space diagonalisation Parallelisation Sets: LPLANE = .F NPAR = 36 NSIM = 4 Write flags LWAVE = .F LCHARG = .F LAECHG = .F LELF = .F LORBIT = 11 麻烦大家看一下，错误在哪里呢？ 另：我用同样的INCAR以及KPOINTS算的其他的此体系的近似体系都是没有错误的，然而就是这个出现了错误，在此任务计算之前，已经做过了结构优化以及静态计算，全部都算完了，没有什么问题…… 再另：天河一号的工作人员告诉我是这些所涉及的节点可能出现了问题，但是，我算的时候提交过好多别的节点了，也都出错了，难道我提交的几乎所有的节点都坏了吗……郁闷阿…… 我的脚本是： #! /bin/bash export LD_LIBRARY_PATH=/vol-th/lib:/vol-th/lib/mklem64t/:$LD_LIBRARY_PATH echo "Job started at: " `date` yhrun -p TH_NET -n 36 ./vasp > ./out echo "Job finished at: " `date` 所产生的out文件是： running on 36 nodes distr: one band on 1 nodes, 36 groups vasp.4.6.36 17Feb09 complex POSCAR found : 2 types and 71 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew WARNING: stress and forces are not correct POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup |
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