【答案】应助回帖

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1楼2011-09-28 13:50:58

cxyuan09

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【答案】应助回帖

lion0528(金币+10): 很感谢你！等我金币多了，送你一朵大红花 2011-09-28 18:45:15

问题说的不明白

感觉你的意思是一个芳环上不同的C原子要使用不同的基组。
如果是这样，你首先需要知道每个碳原子的编号，也就是这些碳放在坐标中的第几行
比如有12个原子，其中六个碳，编号分别是2,3,4,6,8,9，你想对前三个使用6-31G，后三个使用3-21G，其他原子都用3-21G*
然后你需要在#打头那一行使用gen关键词，在输入文件坐标之后空一行在输入以下信息：

2 3 4 0
6-31G
****
6 8 9 0
3-21G
****
1 5 7 10-12 0
3-21G*
****

2楼2011-09-28 15:25:21

lion0528

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引用回帖:

2楼: Originally posted by cxyuan09 at 2011-09-28 15:25:21:
问题说的不明白

感觉你的意思是一个芳环上不同的C原子要使用不同的基组。
如果是这样，你首先需要知道每个碳原子的编号，也就是这些碳放在坐标中的第几行
比如有12个原子，其中六个碳，编号分别是2,3,4,6,8, ...

谢谢！你理解的对。我要是再多三个金币，我就送你一朵大红花

我的芳环是六苯并苯。按照这样的方法输入，GAUSSIAN09的输出结果总是显示Unrecognized atomic symbol c1。这是我的输入文件，麻烦您看一下

3楼2011-09-28 18:36:54

cxyuan09

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★ ★ ★ ★ ★
zhou2009(金币+5): 2011-10-25 15:43:51

你当前的这个太麻烦了，我给你修改了一下。
你运行看看。

%chk=coronene-kr-hollow
%mem=7500MB
%nprocshared=4
#p scan mp2/gen scf=tight

coronene-kr-hollow  (c1 c23 c20 c2 c10 c6 c24 c16 c19 c15 c7 c5)/avtz  C,H/AVDZ

0 1
c                1.23062200 0.71050000 0.00000000
c                -1.23062200 -0.71050000 0.00000000
c                2.46124400 2.84200000 0.00000000
c                1.23062200 3.55250000 0.00000000
c                0.00000000 2.84200000 0.00000000
c                0.00000000 1.42100000 0.00000000
c                -2.46124400 1.42100000 0.00000000
c                -2.46124400 2.84200000 0.00000000
c                -1.23062200 3.55250000 0.00000000
c                -1.23062200 0.71050000 0.00000000
c                -3.69186600 -0.71050000 0.00000000
c                -3.69186600 0.71050000 0.00000000
c                -1.23062200 -3.55250000 0.00000000
c                -2.46124400 -2.84200000 0.00000000
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c                2.46124400 -1.42100000 0.00000000
c                2.46124400 -2.84200000 0.00000000
c                1.23062200 -3.55250000 0.00000000
c                0.00000000 -2.84200000 0.00000000
c                0.00000000 -1.42100000 0.00000000
c                3.69186600 0.71050000 0.00000000
c                3.69186600 -0.71050000 0.00000000
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c                2.46124400 1.42100000 0.00000000
H                3.38789100 3.37700000 0.00000000
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H                -4.61851300 -1.24550000 0.00000000
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H                1.23062200 -4.62250000 0.00000000
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H                4.61851300 1.24550000 0.00000000
X                0.00000000 0.00000000 0.00000000
kr 37 R 2 90. 20 90.

R 3.3 8 0.05

1 2 5 6 7 10 15 16 19 20 23 24 0
aug-cc-pvtz
****
3 4 8 9 11-14 17 18 21 22 25-36 0
aug-cc-pvdz
****
38    0
S 18 1.00
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2151.6597000          -0.0286992
938.0325100          -0.0686679
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S 18 1.00
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426.5573200          -0.0183021
201.0666000          -0.0287559
   97.0976050          -0.0167324
   42.9987240             0.0652410
   21.1770750             0.1834422
   10.4267520             0.0692183
   4.5850080          -0.3156034
   2.1176030          -0.5031501
   0.3492250             0.7171571
S 1 1.00
   0.7070570             1.0000000
S 1 1.00
   0.1448210             1.0000000
S 1 1.00
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P 11 1.00
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   51.1555690             0.3848556
   23.6826760             0.3626340
   10.8754840             0.1170818
   4.9551310             0.0051210
   2.2172670             0.0017539
   0.3221540             0.0002199
P 11 1.00
9366.3090000          -0.0001720
2219.5543000          -0.0015025
719.4528800          -0.0082269
273.4644600          -0.0328566
114.7522500          -0.0950135
   51.1555690          -0.1833106
   23.6826760          -0.1612161
   10.8754840             0.1787644
   4.9551310             0.5437885
   2.2172670             0.3913387
   0.3221540          -0.0047800
P 11 1.00
9366.3090000             0.0000466
2219.5543000             0.0004100
719.4528800             0.0022328
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114.7522500             0.0260115
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   10.8754840          -0.0615040
   4.9551310          -0.2003424
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P 1 1.00
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P 1 1.00
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P 1 1.00
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D 7 1.00
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133.9647700             0.0121715
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D 1 1.00
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D 1 1.00
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F 1 1.00
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F 1 1.00
   0.3280000             1.0000000
****

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4楼: Originally posted by cxyuan09 at 2011-09-28 20:40:02:
你当前的这个太麻烦了，我给你修改了一下。
你运行看看。

%chk=coronene-kr-hollow
%mem=7500MB
%nprocshared=4
#p scan mp2/gen scf=tight

coronene-kr-hollow (c1 c23 c20 c2 c10 c6 c24 c16 c19 c1 ...

实在太感谢了我研究了一下ONIOM 正试着呢真的谢谢你

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lion0528

5楼2011-09-30 11:40:11

lion0528

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5楼: Originally posted by lion0528 at 2011-09-30 11:40:11:
实在太感谢了我研究了一下ONIOM 正试着呢真的谢谢你

最近又有点问题你看你能帮忙解决一下不我用 SCAN WB97XD/AVTZ SCF=tight 计算六苯并苯和氪的体系SCF能量总是不收敛而且还振荡
我试过的方法有
1.wb97xd/vtz link wb97xd/avtz
2.不用扫描的方法改成单点计算能量 SCF=SLEAZY 但计算精度太低，导致结果出现了wenti
3.scf(tight,symm)
4.scf(tight,dsymm)
5.scf(maxcycle=100,xqc)
6.scf(tight,ndamp=10)

6楼2011-10-25 15:29:20

游子8921

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kr 37 R 2 90. 20 90.

R 3.3 8 0.05

1 2 5 6 7 10 15 16 19 20 23 24 0
aug-cc-pvtz
****
3 4 8 9 11-14 17 18 21 22 25-36 0
aug-cc-pvdz
****
38    0
S 18 1.00
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113084.5700000             0.0009733
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  13312.2090000             0.0114167
5189.9883000             0.0331325
2151.6597000             0.0854464
938.0325100             0.1869124
426.5573200             0.3149761
201.0666000             0.3343334
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S 18 1.00
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S 18 1.00
11718113.0000000          -0.0000002
1754604.4000000          -0.0000018
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P 11 1.00
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P 1 1.00
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D 7 1.00
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D 1 1.00
   0.8084090             1.0000000
D 1 1.00
   0.3006000             1.0000000
D 1 1.00
   0.1257000             1.0000000
F 1 1.00
   0.6622000             1.0000000
F 1 1.00
你好，你写的这些是什么意思？我不明白，能否解释一下，谢谢

为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能

7楼2012-02-08 15:56:19

lion0528

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帖子: 175
在线: 67.3小时
虫号: 1269238
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专业: 理论和计算化学

引用回帖:

7楼: Originally posted by 游子8921 at 2012-02-08 15:56:19:
kr 37 R 2 90. 20 90.

R 3.3 8 0.05

1 2 5 6 7 10 15 16 19 20 23 24 0
aug-cc-pvtz
****
3 4 8 9 11-14 17 18 21 22 25-36 0
aug-cc-pvdz
****
38 0
S 18 1.00
11718113.0000000 ...

在 BASIS SET 网站里找的 Kr的AVtZ基组说明

8楼2012-02-10 16:31:33