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phonwa

银虫 (小有名气)

[求助] DGGE高手请进,求指导!

tuzi27:最近做DGGE遇到一些问题,请各位大侠帮忙分析下原因!
前面三个图片分别:第一张是DNA提取的电泳图,用试剂盒提取的土壤DNA。第二章图片是PCR扩增的图片,大小大概是900+bp,第三张是用第一次扩增出来的DNA再次扩增的图片,细菌的V3区,大小200+bp。这是PCR图片。之后的是DGGE图片。80V 14h ,电泳前200V,35min预电泳。第四张是,银染图片,第五张是SYBR green 1 染的图片。
请各位高手指点一下,是咋回事。迷茫了一周。








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phonwa

银虫 (小有名气)

忘说了,变形范围是35%-65%
2楼2011-09-22 16:30:14
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phonwa

银虫 (小有名气)

没人看啊,帮个忙啊,各位大侠!

自己顶起!
3楼2011-09-23 17:04:13
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girlfisher

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

phonwa(金币+3): 2011-09-24 15:50:42
带GC clamp了吗?
为什么要做巢式PCR,严重bias,是为了减少污染问题?
电泳时间减少有利于条带清晰度
4楼2011-09-24 09:02:42
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phonwa

银虫 (小有名气)

带了GC clamp,就是引物是半年前合成的,之前因为各种原因,没地做DGGE!
不是为了减少污染
就是为了减少非特异性扩增
5楼2011-09-24 15:52:52
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怎么都行

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

phonwa(金币+2): 2011-09-26 11:13:41
感觉像是胶没做好,没有形成梯度
6楼2011-09-24 17:58:24
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phonwa

银虫 (小有名气)

可能把,正在努力把胶做好,目前都严格按照要求去做,灌胶速度也不算快,大概2-3分钟。
7楼2011-09-26 11:15:01
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在雨中

金虫 (著名写手)


胶没有做好吧。
8楼2011-09-26 12:38:45
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phonwa

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 在雨中 at 2011-09-26 12:38:45:
胶没有做好吧。

哦,加你好友了。以后多向你请教!
9楼2011-09-28 16:28:59
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foxmygod

银虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
DGGE实验现在进展如何?问题都解决了么?
10楼2012-04-22 01:44:05
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