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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 这句话怎么个理解？这个能量怎么计算？
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ludeng8710

新虫 (小有名气)

[求助] 这句话怎么个理解？这个能量怎么计算？

EA(B) is the energy of A monomer when all the nucleus structure units of B are considered as puppet atoms of carrying an empty orbital;
求 这句话怎么个理解？这个能量怎么计算？
谢谢~
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1楼2011-09-20 11:07:58
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
1楼: Originally posted by ludeng8710 at 2011-09-20 11:07:58:
EA(B) is the energy of A monomer when all the nucleus structure units of B are considered as puppet atoms of carrying an empty orbital;
求 这句话怎么个理解？这个能量怎么计算？
谢谢~

2楼2011-09-20 15:36:39
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
请参照BSSE校正的相关说明。
在Gaussian中实现，请参照counterpoise的使用说明。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
3楼2011-09-20 15:50:18
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangmt at 2011-09-20 15:50:18:
请参照BSSE校正的相关说明。
在Gaussian中实现，请参照counterpoise的使用说明。

"计算A、B分子间的弱相互作用能时，一般不能简单地通过E_interaction = E_AB - E(A) - E(B)来计算，因为E_AB能量相对于E(A) + E(B)的降低来自两方面，一方面是真实的A、B分子间的相互作用能，这是我们要求的；另一方面来自于A、B分子的基函数在复合物体系中重叠，相当于增大了复合物的基组而使E(AB)能量降低（严格来说前提是所用的理论方法是基于变分原理的），这个部分贡献如果也掺入E_interaction，则高估了相互作用能（即实际上结合能没有算出来的那么负），所以要去掉，它称为Basis Set Superposition Error(BSSE)。所以双分子的相互作用能应该表述为E_interaction = E_AB - E(A) - E(B) + E_BSSE"

BSSE是A、B单体分子间相互作用时需要进行较正的，
但那句话说的好像是对单体A的计算，
对那句话还不是很懂 求详解 谢谢~
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4楼2011-09-20 16:15:41
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

ludeng8710(金币+80): 谢谢~ 2011-09-20 16:56:53
如果单个算，就用Bq的方法（不用counterpoise），就是先把所有的原子（包括A，B两部分）都录入进来，然后把属于B的原子的名称后面都加上Bq的标记，如
C-Bq 0.234 1.236 0.987
这样的形式，然后单点算，此时A的能量就会有所下降（由于提供了所有B中原子能提供的基函数）。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
5楼2011-09-20 16:45:39
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ludeng8710

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangmt at 2011-09-20 16:45:39:
如果单个算，就用Bq的方法（不用counterpoise），就是先把所有的原子（包括A，B两部分）都录入进来，然后把属于B的原子的名称后面都加上Bq的标记，如
C-Bq 0.234 1.236 0.987
这样的形式，然后单点算，此时A的能 ...

意思是将B单体中的原子用空原子后缀(Bq)指定，只提供B中原子的所有基函数是吧？
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6楼2011-09-20 17:02:10
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
引用回帖:
6楼: Originally posted by ludeng8710 at 2011-09-20 17:02:10:
意思是将B单体中的原子用空原子后缀(Bq)指定，只提供B中原子的所有基函数是吧？

应该就是的
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
7楼2011-09-20 19:53:32
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