应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 在MS的DPD模拟中，如何使粗粒化分子具有刚性结构？
51/1返回列表
查看: 1917  |  回复: 15
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

jolly1987

金虫 (小有名气)

[求助] 在MS的DPD模拟中，如何使粗粒化分子具有刚性结构？

请问在MS的DPD模拟中，如何使粗粒化分子具有刚性结构？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2011-09-19 17:29:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jolly1987

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yahoohoo at 2011-09-19 21:35:09:
抛开MS，取决于分子的结构，你可以考虑加入harmonic constraint

太高深了，在Google上没有查到定义~不知大侠用的是什么软件？
赞一下 回复此楼
3楼2011-09-20 08:29:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
jolly1987(金币+1): 2011-09-20 08:26:11
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-09-20 22:00:54
引用回帖:
1楼: Originally posted by jolly1987 at 2011-09-19 17:29:22:
请问在MS的DPD模拟中，如何使粗粒化分子具有刚性结构？

抛开MS，取决于分子的结构，你可以考虑加入harmonic constraint
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-09-19 21:35:09
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-09-20 22:01:08
jolly1987(金币+1): 2011-09-28 14:18:17
jolly1987(金币+1): 2012-03-04 09:31:40
引用回帖:
3楼: Originally posted by jolly1987 at 2011-09-20 08:29:19:
太高深了，在Google上没有查到定义~不知大侠用的是什么软件？

比如说你想固定键角$\theta$，那么可以用势能形式$U=k(\theta-\theta_0)^2$，$\theta_0$为平衡值。这就是所谓的harmonic constraint。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-09-20 13:16:42
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjw040

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yahoohoo at 2011-09-20 13:16:42:
比如说你想固定键角$\theta$，那么可以用势能形式$U=k(\theta-\theta_0)^2$，$\theta_0$为平衡值。这就是所谓的harmonic constraint。

请问，我如果加上二面角的限制，该如何？除了MS还有其他做DPD的吗？帮忙推荐一下！
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-09-21 19:39:30
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭