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恶魔眼球

木虫 (小有名气)

[求助] 基因表达分析怎样做

大虾们，小妹我要做一个关于鸡的基因表达调控分析，目的就是要加深对其基因组结构和基因多态性的认识。一般操作步骤如何？
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1楼 2011-09-15 11:40:21
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zhengchengli

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

恶魔眼球(金币+1): 太简略了，没有达到我想要的目的。 2011-09-15 14:33:40
可以用荧光定量， 也可以用PCR定量，都行。
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2楼2011-09-15 13:59:11
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)
引用回帖:
1楼: Originally posted by 恶魔眼球 at 2011-09-15 11:40:21:
大虾们，小妹我要做一个关于鸡的基因表达调控分析，目的就是要加深对其基因组结构和基因多态性的认识。一般操作步骤如何？

能够详细一点吗？我也知道要PCR，我还想做SNP筛查呢，筛查以后还要怎么做呢？而且为什么要这样做？
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3楼2011-09-15 14:35:24
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, MolEPI+1): very good 2011-09-15 18:28:55
第一步，拿基因或明确你要研究的基因
第二步，研究该基因的蛋白质结构域，在NCBI中调出该基因家族的其他成员并对其进行分类以及系统发育树分析，初步明确该基因的功能
第三步，研究该基因的亚细胞定位，推测其蛋白性质，如是否作为转录因子在核内还是其它等等
第四步，研究该基因的表达模式：表达水平及其组织特异性，不同发育阶段的表达特点（一般RT-PCR比较方便）
第五步，某些因素（营养、激素等处理）对该基因表达的影响。（一般可以做RT-PCR，Northern就算了）
第六步（可在第二步与第三步之间），在不同的鸡品种中，拿出该基因，研究该基因在不同品种中的多态性进行分析（可尝试关联分析）研究该基因对表型的影响，并研究这些多态性的特点以及相关的品种间的保守性。
以及 研究与其作用的其它基因以及相关的信号途径等等
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真相是最大的奢侈品
4楼2011-09-15 15:01:42
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923&fpage=1 如何用NCBI
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3234286&fpage=1如何做RT-PCR
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3506777&fpage=1如何跑电泳
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恶魔眼球
真相是最大的奢侈品
5楼2011-09-15 15:08:04
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-15 15:01:42:
第一步，拿基因或明确你要研究的基因
第二步，研究该基因的蛋白质结构域，在NCBI中调出该基因家族的其他成员并对其进行分类以及系统发育树分析，初步明确该基因的功能
第三步，研究该基因的亚细胞定位，推测其蛋 ...

太感谢楼上的了，我就是想要这么详细的！
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6楼2011-09-15 15:10:07
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
引用回帖:
6楼: Originally posted by 恶魔眼球 at 2011-09-15 15:10:07:
太感谢楼上的了，我就是想要这么详细的！

任务有点大，如连同信号通路做完，估计要好几年，做完后就能发大SCI 文章了！楼主还是要三思！时间耗不起！
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真相是最大的奢侈品
7楼2011-09-15 15:15:53
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-15 15:08:04:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923&fpage=1 如何用NCBI
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3234286&fpage=1如何做RT-PCR
[url]http://muchong.com/bbs/view ...

谢谢~~
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8楼2011-09-15 16:50:32
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-15 15:15:53:
任务有点大，如连同信号通路做完，估计要好几年，做完后就能发大SCI 文章了！楼主还是要三思！时间耗不起！

肯定不会全都做啦，只是选取一部分来完成足矣！
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9楼2011-09-15 16:52:06
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pxq88888

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
1479841楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-15 15:15:53
任务有点大，如连同信号通路做完，估计要好几年，做完后就能发大SCI 文章了！楼主还是要三思！时间耗不起！...

一看就知道要很长时间，混个研究生证没必要那么拼命吧。
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10楼2012-11-20 16:10:30
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