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汕头大学海洋科学接受调剂
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rangaisuifeng

银虫 (正式写手)

[交流] 大家讨论一下生物界中存在的酶(三维空间尺寸)最小的是哪一个 已有9人参与

可以提供每种酶的三维空间直径,我目前只知道一种,葡萄糖氧化酶(6.7,6.7,21.5)nm,辣根过氧化物酶(4.6,7.4,8.0)
欢迎大家补充,并介绍一下其反应底物,及三维空间直径
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既然前面的路,我们无法预知,就让我们大胆的去尝试吧
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

★ ★ ★ ★
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西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-10-10 23:26:08
锤头状核酶长约30个核苷酸,由三个碱基配对的螺旋区、两个单链区和膨出的核苷酸构成。该酶可分为3个部分,中间是以单链形式存在的13个保守核苷酸和螺旋Ⅱ组成的催化核心,两侧的螺旋Ⅰ/Ⅲ为可变序列,共同组成特异性序列,决定核酶的特异性。
底物 mRNA 切割
大致三维尺寸 高度 3.5–8 nm 平均直径 1.5nm
体外研究证明,最小的核酶只有3个核苷酸单元


[ Last edited by wanhscn on 2011-9-15 at 10:42 ]
真相是最大的奢侈品
2楼2011-09-15 10:39:06
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rangaisuifeng

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yipaishi at 2011-10-25 23:41:05:
请教,三维空间直径是怎么个概念?6.7,6.7,21.5 nm又是怎么描述分子的?

就是酶的空间结构 长,宽,高的长度,大部分都是通过XRD表征得到其三维参数的,汇总一下,应该对大家都很有帮助的
既然前面的路,我们无法预知,就让我们大胆的去尝试吧
4楼2011-10-28 15:56:18
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rangaisuifeng

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by yipaishi at 2011-10-28 17:17:25:
那么请问你所说的GOD是来源于黑曲霉A.niger吗?您有的数据有相关文献吗?我怎么刚查的有说是18*12*1.3nm(Direct observation of native and unfolded glucose oxidase structures by scanning tunnelling micro ...

美国的数据库有的,有参考文献,通过XRD方法得到的三维直径
既然前面的路,我们无法预知,就让我们大胆的去尝试吧
6楼2011-10-31 20:56:43
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yunxiao8252

铜虫 (小有名气)


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送红花一朵
求指导,这些数据是在哪里查的呀,嗯,我在PDB里能查到的好像只有几种,不知道是不是方法不对,请问楼主知道虫漆酶的三维尺寸么?急求赐教,不甚感激
10楼2013-07-15 14:39:35
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普通回帖

yipaishi

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by rangaisuifeng at 2011-09-15 09:16:06:
可以提供每种酶的三维空间直径,我目前只知道一种,葡萄糖氧化酶(6.7,6.7,21.5)nm,辣根过氧化物酶(4.6,7.4,8.0)
欢迎大家补充,并介绍一下其反应底物,及三维空间直径

请教,三维空间直径是怎么个概念?6.7,6.7,21.5 nm又是怎么描述分子的?
3楼2011-10-25 23:41:05
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yipaishi

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
wanhscn(金币+2): 鼓励交流! 2011-10-28 17:56:26
引用回帖:
4楼: Originally posted by rangaisuifeng at 2011-10-28 15:56:18:
就是酶的空间结构 长,宽,高的长度,大部分都是通过XRD表征得到其三维参数的,汇总一下,应该对大家都很有帮助的

那么请问你所说的GOD是来源于黑曲霉A.niger吗?您有的数据有相关文献吗?我怎么刚查的有说是18*12*1.3nm(Direct observation of native and unfolded glucose oxidase structures by scanning tunnelling microscopy)
5楼2011-10-28 17:17:25
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zhaoyuting

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
????
吃得苦中苦,方为人上人!
7楼2011-11-29 09:17:14
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ldpirlo

新虫 (初入文坛)


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楼主这个在哪里查到的,我在PDB怎么查不到喃?
8楼2012-03-09 16:43:50
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aq2700

木虫 (正式写手)


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就是就是 我要查脂肪酶的 在PDB上没看到这样具体的数字的啊
  
求指导
9楼2012-11-29 15:33:27
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