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gjh123

金虫 (正式写手)

[求助] vasp 并行运算出错

使用openmpi 并行编译的vasp 每次运行时都会出现下面的错误而不能运行,哪位vasp 的高手知道,能帮忙解答一下啊。
       错误:mpirun noticed that process rank 1 with PID 3716 on node localhost.localdomain exited on signal 11 (Segmentation fault).
       本来以为是因为内存不够的原因,又买了个2G 的内存条加上后(总共4G内存),运行vasp显示只用了60% 左右的内存,但还是出现上面的错误而不能继续运行下去。郁闷啊!有什么方法可以解决一下吗?
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后天一

木虫 (小有名气)

我们的自由!

【答案】应助回帖


gjh123(金币+20): 2011-09-07 17:36:49
zzy870720z(金币+1): 谢谢指点 2011-09-08 09:13:58
我以前经常碰到这个错误提示,这个问题的原因比较复杂,和编译器有关系,试试在FFLAGS 选项的赋值中增加  
-heap-arrays  64
重新编译vasp,不过通常不管啥用,换个编译器比如PGI,可以解决问题。
4楼2011-09-07 16:39:57
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顺水

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


gjh123(金币+10): 2011-09-07 16:39:30
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-09-08 09:13:47
(总共4G内存),
多少原子啊?
可能是内存不足
2楼2011-09-07 16:28:10
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gjh123

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 顺水 at 2011-09-07 16:28:10:
(总共4G内存),
多少原子啊?
可能是内存不足

有80个原子,但是运行时,内存显示只用了2.1G左右。内存够的啊。
3楼2011-09-07 16:39:02
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gjh123

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 后天一 at 2011-09-07 16:39:57:
我以前经常碰到这个错误提示,这个问题的原因比较复杂,和编译器有关系,试试在FFLAGS 选项的赋值中增加  
-heap-arrays  64
重新编译vasp,不过通常不管啥用,换个编译器比如PGI,可以解决问题。

非常谢谢,加上FFLAGS= -heap-arrays 64这个赋值编译出的vasp, 已经运行成功了。刚刚也从这个贴子中发现了这个解决的方法。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2493388&fpage=1.  再次感谢各位的帮助。
5楼2011-09-07 17:36:40
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