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zhaoyxcas

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 芳香性问题

请教一下,算芳香性时加入鬼原子,想加到一规则四元环平面的上方1A处,输入文件上应怎样改。谢谢了!!!
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-10-22 10:51:56
假设你的分子建在XOY面:
第一步找到几何中心:就是x,y,z坐标分别相加之后除以4,坐标为(a,b,0)
第二步:1A处的,为(a,b,1.0)
前途光明,出路难觅!
5楼2011-09-05 15:27:30
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

【答案】应助回帖

zhaoyxcas(金币+5): 谢谢! 2011-09-05 15:14:40
这个不属于量化问题,属于几何问题。
前途光明,出路难觅!
2楼2011-09-04 12:41:50
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zmcommon

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

zhaoyxcas(金币+5): 谢谢呀 2011-09-05 15:14:16
你的问题是不是不知道怎么找四元环中心位置呀??如果你能找到中心,在中心坐标的基础上,对垂直平面轴方向的坐标加1就行了。例如中心位置是0,0,0,所在平面为XY平面,那鬼原子坐标就是0,0,1
3楼2011-09-05 08:39:21
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zhaoyxcas

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zmcommon at 2011-09-05 08:39:21:
你的问题是不是不知道怎么找四元环中心位置呀??如果你能找到中心,在中心坐标的基础上,对垂直平面轴方向的坐标加1就行了。例如中心位置是0,0,0,所在平面为XY平面,那鬼原子坐标就是0,0,1

我试过了,就不在中心的上方,很多文献给不规则的环加各种鬼原子都能加的上,真不知怎么加上的。
4楼2011-09-05 10:09:23
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