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youngsun50

木虫 (正式写手)


[交流] 细菌总蛋白SDS-PAGE时菌体处理出现粘稠物??

如题,步骤为1ml菌体离心,沉淀加入了100ul的1*SDS凝胶加样缓冲液,100度煮4min,,12000g离心4min,结果没有沉淀出现,均有一坨粘稠物。
请问,各位虫友,这是什么原因?? 另,有的说煮沸10min,请问煮沸过长对蛋白有影响吗,我的样品为肺炎克雷伯杆菌(G-菌)?
谢谢
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youngsun50(金币+1):谢谢参与
西瓜(金币+5, MolEPI+1): Good!很精辟的解答! 2011-08-26 17:39:27
粘稠也是正常的,细胞煮沸之后核酸等物质都释放出来了,但一般离心之后还是有沉淀出来的,取上清上样。我们一般煮沸10min,煮沸过长对SDS-PAGE跑蛋白没有影响的。
2楼2011-08-26 16:43:34
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friya0910

新虫 (正式写手)



youngsun50(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-08-26 16:43:34:
粘稠也是正常的,细胞煮沸之后核酸等物质都释放出来了,但一般离心之后还是有沉淀出来的,取上清上样。我们一般煮沸10min,煮沸过长对SDS-PAGE跑蛋白没有影响的。

您好,我想请问一下,我今天做诱导,取500微升菌液,12000rpm离心1min,弃上清,用50微升灭菌水重悬后加50微升2×上样buffer,然后100℃煮沸5min,12000rpm离心1min,然后取上清,20微升装一管,可是当我吸到最后的时候没有看到有沉淀啊?也没像楼上说的出现粘稠,是不是没裂解好啊?因为上样buffer颜色太深了,沉淀也不是特别容易观察,我想请问你们都能看到沉淀吗?
3楼2011-08-26 17:53:03
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by friya0910 at 2011-08-26 17:53:03:
您好,我想请问一下,我今天做诱导,取500微升菌液,12000rpm离心1min,弃上清,用50微升灭菌水重悬后加50微升2×上样buffer,然后100℃煮沸5min,12000rpm离心1min,然后取上清,20微升装一管,可是当我吸到最后 ...

正如你说的,沉淀不容易看到的。不黏稠和没看到沉淀不能代表没处理好。按照你的方法处理一般没问题的。
4楼2011-08-26 19:43:24
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youngsun50

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-08-26 16:43:34:
粘稠也是正常的,细胞煮沸之后核酸等物质都释放出来了,但一般离心之后还是有沉淀出来的,取上清上样。我们一般煮沸10min,煮沸过长对SDS-PAGE跑蛋白没有影响的。

请问,那为什么一般情况没有粘稠物这情况呢,是不是我的菌过浓啊,另G-菌煮沸10min没问题吧??
5楼2011-08-26 22:14:10
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by youngsun50 at 2011-08-26 22:14:10:
请问,那为什么一般情况没有粘稠物这情况呢,是不是我的菌过浓啊,另G-菌煮沸10min没问题吧??

粘稠跟菌的量、菌的种类都有关系的,不要纠结是否黏稠,把握一个原则:上样的时候尽量取上清。
我们经常使用的大肠杆菌也是典型的G-菌,煮沸10min都没问题的。
6楼2011-08-27 08:09:57
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youngsun50

木虫 (正式写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-08-27 08:09:57:
粘稠跟菌的量、菌的种类都有关系的,不要纠结是否黏稠,把握一个原则:上样的时候尽量取上清。
我们经常使用的大肠杆菌也是典型的G-菌,煮沸10min都没问题的。

谢谢
7楼2011-08-27 09:35:54
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