应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodock安装好后导入分子为什么不对（附图）
51/1返回列表
查看: 3418  |  回复: 18
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

可米kemi

银虫 (小有名气)

[求助] autodock安装好后导入分子为什么不对（附图）

因为，要使用AUTODOCK，所以参考网上资料，学着安装AUTODOCK和AUTODOCKTOOLS，具体参考步骤如下（见附件）。
     安装完毕后，打开ADT，界面倒是和网上的一样。问题是通过File→Read Molecule导入分子后，分子呈现的是灰色的，而且固定无法转动。并且按照Select→Select From String，Add→Dismiss，Edit→Delete→Delete AtomSet→Continue去水，界面上的分子就消失了。
    所导入的分子是从CCDC上找的，通过格式转化成pdb格式。
    我已经弄了两天了，实在没办法，请各位帮忙看下，到底是怎么回事，谢谢哈。

[ Last edited by 可米kemi on 2011-8-24 at 23:31 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-08-24 21:43:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

可米kemi

银虫 (小有名气)
再顶下，会不会是官网上的下载方式已经过时了？那有没有最新的呢？
赞一下 回复此楼
3楼2011-08-25 17:38:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★
可米kemi(金币+5): 谢谢指教哈。 2011-08-30 11:04:30
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-08-30 15:59:56
可米kemi(金币+15): 2011-08-31 10:27:07
Select→Select From String，Add→Dismiss，Edit→Delete→Delete AtomSet→Continue去水，去个水有这么复杂吗？俺以前都是在PYMOL里把水给去掉的
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-08-26 20:05:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

可米kemi

银虫 (小有名气)
我也是在官方网站上学的。后来没办法改用Accelrys软件手动去水了。但现在去水加氢后，存为pdb格式，然后分别用ligand和grid还是无法导入，再加上之前用file导入的分子无法转动，我一直在猜是不是软件哪里没安装好。
赞一下 回复此楼
5楼2011-08-26 21:41:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

可米kemi

银虫 (小有名气)
找到原因，用ligand和grid导入的时候，下面的格式得改成pdb的才行。
赞一下 回复此楼
6楼2011-08-29 21:18:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭