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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 请教各位同学和老师，用什么软件可以避开编程没学好的同学呢？
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ldxdwn

金虫 (小有名气)

[交流] 请教各位同学和老师，用什么软件可以避开编程没学好的同学呢？

自己刚刚开始接触这个领域，没有人教，属于自己正在摸索的。一开始觉得困难重重，到了这个论坛以后，发现有这么多的同学和老师都在做这个分子模拟，立刻觉得不孤独了。
我是一个很普通的高校的学生，可能理论基础和计算机基础都不是很强，在这一方面可以说没有天赋。尤其是计算机编程，考了两次，才过了江苏省计算机二级C++。请问各位，我能学好这些分子模拟的东西吗？或者能提供一些学习的方法吗？从哪里入手呢？我想学习GCMC模拟的相关东西，用哪个软件能让我稍微排除学这个的困难呢？
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1楼 2011-08-20 15:44:32
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ahehyh

木虫 (正式写手)
★ ★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-08-20 23:23:23
用一些图形化的软件，比如hyperchen，MS等
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2楼2011-08-20 22:28:58
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q1036210267

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-23 22:16:37
MS可以，我也是刚接触分子模拟不久。好像towhee功能更强大

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼2011-08-22 13:54:10
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-23 22:16:47
计算机语言总比分子模拟好学吧
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4楼2011-08-22 22:51:28
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xinji

铜虫 (小有名气)
★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
3楼: Originally posted by q1036210267 at 2011-08-22 13:54:10:
MS可以，我也是刚接触分子模拟不久。好像towhee功能更强大
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

但是towhee运行很慢，这该如何解决？？？
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5楼2011-08-25 09:06:49
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-08-26 20:41:13
引用回帖:
5楼: Originally posted by xinji at 2011-08-25 09:06:49:
但是towhee运行很慢，这该如何解决？？？

编译优化。。。
并行处理。。。
貌似这个也对编程有要求。。。。
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6楼2011-08-25 11:29:57
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xinji

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 风间的记忆 at 2011-08-25 11:29:57:
编译优化。。。
并行处理。。。
貌似这个也对编程有要求。。。。

在towhee中有并行处理吗？貌似它的并行文件可以达到同时执行多个文件的目的，却无法使一个任务在多个CPU上运行，是这样吗？如果可以的话，颖则样处理呢？我在towhee中并未找到相关介绍。
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7楼2011-08-25 11:56:52
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-08-26 20:40:55
引用回帖:
7楼: Originally posted by xinji at 2011-08-25 11:56:52:
在towhee中有并行处理吗？貌似它的并行文件可以达到同时执行多个文件的目的，却无法使一个任务在多个CPU上运行，是这样吗？如果可以的话，颖则样处理呢？我在towhee中并未找到相关介绍。

这个做的不多。。
LAMMPS现在用的也比较多，而且并行支持也比较好
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8楼2011-08-25 12:10:20
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xinji

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 风间的记忆 at 2011-08-25 12:10:20:
这个做的不多。。
LAMMPS现在用的也比较多，而且并行支持也比较好

你是用LAMMPS吗?它能进行相平衡模拟吗？你用它是做动力学模拟还是其他的？？？
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9楼2011-08-25 12:16:56
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leimiao_hit

木虫之王 (文学泰斗)
★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
MS不错
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11楼2011-08-25 21:31:01
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leimiao_hit

木虫之王 (文学泰斗)
★
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-08-26 20:41:47
图形化的软件
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18楼2011-08-26 02:08:13
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13500558820

银虫 (文坛精英)
帮顶下
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19楼2011-08-26 07:50:12
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youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)
★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
同样关注 期待达人
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23楼2011-09-01 15:20:50
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yunnanyan

至尊木虫 (文坛精英)
★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
同样希望得到好的建议
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24楼2011-09-05 17:29:03
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yyaletta

铜虫 (初入文坛)
★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
我也是刚接触这个领域，没人教，正苦恼着呢
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25楼2011-09-07 10:30:43
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zhang_jaj

木虫 (正式写手)
★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
同为学术沦落人
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26楼2011-12-22 17:13:23
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quanta

新虫 (小有名气)
★
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
towhee是基于MC的，理论上说是可以用很多次的模拟来代替并行的。
lammps是MD，并行非常好，如果用infiniband的话，可以同时使用上百个节点同时效率保持在80％以上。
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27楼2011-12-22 17:48:02
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简单回复
谦恭四海10楼
2011-08-25 21:13   回复  
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
20091262212楼
2011-08-25 21:44   回复  
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
祝福
leimiao_hit13楼
2011-08-25 21:55   回复  
lehuijun14楼
2011-08-25 22:11   回复  
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
1350055882015楼
2011-08-25 22:24   回复  
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
leimiao_hit16楼
2011-08-25 22:33   回复  
tjcdp17楼
2011-08-26 01:14   回复  
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
xiaocui198720楼
2011-08-26 08:23   回复  
ldxdwn(金币+1):谢谢参与
persistent0621楼
2011-08-26 08:24   回复  
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lxzhq22楼
2011-08-26 14:50   回复  
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