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飞翔的诗人

银虫 (小有名气)

[求助] 引物及载体/宿主菌选择(用于酶表达)

本人查到的Alcaligenes faecalis DA1 D-氨基酰化酶序列只有CDS区,为了表达这种酶, 设计引物是不是就没得选择,上游引物只能是从ATG开始的一段序列,下游引物就是终止密码前的一段序列了(用软件看这两段引物得分都很低,目的基因可能不好P)。相应地载体该如何选择,比如怎么判断载体上有没有合适的启动子,我打算就用实验室的PET 30a做表达,宿主菌就用BL21,这样选择有没有什么问题。下面附上了我查到的目的序列,
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..1455
                     /organism="Alcaligenes faecalis"
                     /mol_type="genomic DNA"
                     /db_xref="taxon:511"
     CDS             1..1455
                     /EC_number="3.5.1.81"
                     /note="DaaAF"
                     /codon_start=1
                     /transl_table=11
                     /product="D-aminoacylase"
                     /protein_id="AAK15530.1"
                     /db_xref="GI:13194736"
                     /translation="MSQPDATPFDYILSGGTVIDGTNAPGRLADVGVRGDRIAAVGDLSASSARRRIDVAGKVVSPGFIDSHTHDDNYLLKHRDMTPKISQGVTTVVTGNCGISLAPLAHANPPAPLDLLDEGGSFRFARFSDYLEALRAAPPAVNAACMVGHSTLRAAVMPDLRREATADEIQAMQALADDALASGAIGISTGAFYPPAAHASTEEIIEVCRPLITHGGVYTHMRDEGEHIVQALEETFRIGRELDVPVVISHHKVMGKLNFGRSKETLALIEAAMASQDVSLDAYPYVAGSTMLKQDRVLLAGRTLITWCKPYPELSGRDLEEIAAERGKSKYDVVPELQPAGAIYFMMDEPDVQRILAFGPTMIGSDGLPHDERPHPRLWGTFPRVLGHYSRDLGLFPLETAVWKMTGLTAAKFGLAERGQVQPGYYADLVVFDPATVADSATFEHPTERAAGIHSVYVNGAAVWEDQSFTGQHAGRVLNRAGA"
ORIGIN      
        1 atgtcccagc ccgacgccac cccgttcgac tacatacttt ccggcggcac cgtcatcgac
      61 ggcacgaacg cgccaggccg gctcgccgac gtgggcgtgc ggggcgatcg gattgccgcc
     121 gtcggcgacc tgagcgccag cagcgcccgc cggcgcatcg acgtggcggg aaaagtggtg
     181 tctccgggct tcatcgactc gcacacgcat gacgacaact acctgctgaa acaccgcgac
      241 atgacgccca agatctcgca gggcgtcacc accgtggtca cgggcaactg cggtatcagt
      301 ctcgccccgc tggcgcacgc caatccgccc gcgccgctgg atctgctgga cgaaggcggc
      361 tcgttccgct ttgcacgctt ctcggactac ctcgaagccc tgcgcgccgc gccgcctgcc
      421 gtcaacgccg cctgcatggt gggccattcc accctgcgcg ccgccgtcat gcccgacttg
      481 cggcgcgaag ccacggccga tgaaatccag gccatgcagg cgctggccga cgatgcgctg
      541 gccagtggcg ccatcggcat ttccacaggc gccttctatc cgcccgccgc ccatgccagc
      601 accgaggaaa tcatcgaagt ctgccgcccc ctgatcacgc atggcggcgt ctacgccacc
      661 catatgcgcg atgagggcga acatatcgtc caggcgctgg aggagacctt ccgcatcggc
      721 cgcgaactgg acgtgccggt cgttatctcg caccacaagg tcatgggcaa gctcaatttc
      781 gggcgctcca aggaaacgct ggccttgatc gaggcggcca tggccagcca ggacgtatcg
      841 ctggacgcct atccctacgt ggcgggctcc accatgctca agcaggaccg cgtcctgctt
      901 gccggccgca cgcttatcac ctggtgcaag ccctatcccg aactgagcgg acgcgacctg
      961 gaagaaatcg ccgccgagcg aggcaagtcc aagtacgacg tggtgcccga actgcagccc
     1021 gccggcgcca tctacttcat gatggacgag cccgacgtgc agcgcatcct ggcgttcggc
     1081 cccaccatga tcgggtccga tggcctgccc cacgacgagc gcccccaccc tcgcctgtgg
     1141 ggaacgtttc cccgggtgct gggccactac tcgcgcgacc tgggcctgtt cccattggag
     1201 accgcggtct ggaaaatgac cggcctgacc gccgccaaat tcggcctggc cgaacggggc
     1261 caggtgcagc ccggctacta cgccgacctg gtggtcttcg acccggccac ggtggcggac
     1321 tcggccacgt tcgagcatcc caccgagcgc gccgcgggca tccattcggt ctacgtcaac
     1381 ggcgcggccg tctgggaaga ccagtcgttc actggccagc atgccggccg cgtcctcaac
     1441 cgggccggag cctga
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

★
西瓜(金币+1): 有道理 2011-08-12 18:21:48
蛋白表达这个不太好说,除了载体、菌株之外,还有诱导条件等因素限制,楼主不妨先用手上的条件试一下!
jiayoubashaonian
2楼2011-08-12 16:28:24
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