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friya0910

新虫 (正式写手)

[求助] 连接体系的确定

这是我酶切载体和目的基因以后切胶回收的电泳图,左边为载体,右边为目的片段,上样量均为2微升,有没有高手帮我看看我的连接体系中载体和目的片段怎么定量啊?我用的是宝生物的T4连接酶,25微升的体系加1微升的酶和2.5微升的buffer。还有一个问题是连接之后的连接液可以直接做转化么?我看说明书上说还要加醋酸钠,无水乙醇沉淀等!
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天使托

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T.Shen

【答案】应助回帖

★ ★ ★
friya0910(金币+4): 2011-08-12 10:07:51
西瓜(金币+3, MolEPI+1): Good! 2011-08-12 11:18:57
1:你为何要点好几个marker,不知道是不是?
2:要做一个比较成功的连接,首先要保证载体和基因酶切的完全并且纯化的干净,这一点不知道楼主有无做到,由图中可以看出来载体还可以,但是基因有些少了,比较暗一点,但是没有关系连接体系中你可以加大基因的量;
3:连接体系的选择,一般情况下我们这里是10ul体系,当然了,还有别的连接体系,但是一般情况下10ul足矣,因为你做转化才需要几ul而已,没有必要太多,太多了反而不利于连接,10ul连接体系中:T4 DNAligase:0.5ul; Buffer:1ul,载体和基因根据电泳结果定量才可以知道,其实关键是要保证他们之间的一个浓度比,这样便于连接而已,按照你图中的亮度,载体加3ul,基因加6ul就可以了。
4:连接前,将载体和基因混合以后,在45度活化10min,连接完成之后也需要45度10min,当然不这样做也可以连接上,这一步只是辅助而已!
祝好运!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
11楼2011-08-12 09:56:54
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

★ ★
西瓜(金币+2): 专家很热心 2011-08-12 17:56:59
引用回帖:
13楼: Originally posted by friya0910 at 2011-08-12 10:15:52:
因为想更确定一下切下来的片段大小。我是把载体用NcoI单酶切一管,用BamHI单酶切一管,然后双酶切一管,跑胶显示三管都是线性的,这样是不是就能说明载体切干净了啊?目的片段是从T载体上切下来的,应该问题不大 ...

网上的公式切勿死板硬套,两者加的比例有一个范围的,要定量一下,其实做的多了,只要肉眼一看便知道大概加多少,没有必要那么精准,做一个克隆不需要浪费那么多时间的。
那么定量呢?就是跟你marker比的,你点了几微升marker 哪一条带最亮,是多少ng,然后再对比你的条带的。。。可能我说的不是很清楚,你看看marker的那张图,每一个大小都是一定的质量。。。

另外转化的话,连接产物转4ul至60或者70ul感受态就行了。。。。
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
15楼2011-08-12 10:26:36
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