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汕头大学海洋科学接受调剂
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vaspstudy

银虫 (小有名气)

[求助] VESTA能否只画晶胞中部分原子的电荷密度图

刚刚接触VESTA,想用VESTA处理VASP的运算结果,有两个问题求教虫友:
(1)vasp算出CHGCAR后可以导入VESTA,给出整个超胞的电荷密度图,但我只关心其中某几个原子附近的电荷密度分布,求教高手,能否只显示我关心的这几个原子上的电荷密度,如果能够,如何实现?
(2)超胞计算中引入了空位,能否在图示中用虚线球给出该空位的理想位置,并且用虚线表示出其本来的成键情况,如果能够,如何操作?
非常感谢!
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gaojunfeng83

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
uuv2010(金币+2): 多谢提示 2011-07-31 18:41:05
vaspstudy(金币+5): 2011-08-01 08:46:41
vesta 似乎是没有办法只显示几个原子的电荷密度的,只关心几个原子,是不是可以考虑差分电荷分析?就是把你要关注的几个原子作为一个体系(去掉其他原子,仍用原来晶格)保持坐标不动,单独算一下,得到CHGCAR1, 然后把其他部分的原子(去掉关心的原子)保持坐标不变再单独算一下,得到CHGCAR2, 然后用总体系的CHGCAR-CHGCAR1-CHCAR2 得到CHGCAR——difference。 然后再用vesta 做CHGCAR-difference。但和你的要求可能有点区别。

引入空位的话,vesta 似乎不能做到你的要求,但是你可以在vesta里面作结构图,然后导出图片,在ppt或者Photoshop 中修改图片。可以得到满足你要求的图片
2楼2011-07-31 10:22:33
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bingmou

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-07-31 22:32:52
vaspstudy(金币+3): 2011-08-01 08:46:52
vaspstudy(金币+1): 2011-08-23 07:06:12
只显示几个原子而不显示其他原子的电荷密度很奇怪的,没有太多意义。我建议你采用截面的方法来显示某几个原子附近的电荷密度分布
3楼2011-07-31 17:43:47
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