24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 4518  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

eyreqiao

新虫 (小有名气)

[交流] CASTEP过渡态搜索,过渡态能量低于反应物已有8人参与

利用CASTEP的过渡态搜索,研究单个原子在表面不同位置之间的扩散。
complete LST/QST,过渡态搜索显示成功,但是结果文件中给出的过渡态能量在反应物之下(扩散路径设置的从能量高的吸附位到能量低的吸附位),这是怎么回事,难道说明这个扩散反应没有势垒?还是我找到的是一个中间的亚稳态?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

专心学术

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by cavediger at 2011-07-13 09:43:27
考虑两个问题:
1. 反应物结构选择是否正确,是否优化到了基态?
2. 如果像你图中所示的那样,TS掉下去了,追踪一下迭代过程,考虑是否计算过程出了问题;如果没有问题,那么考虑一下是否存在反应中间物种,针对 ...

你好,我想问一下 过渡态能量势垒有正有负说明什么
12楼2018-07-19 16:47:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

eyreqiao

新虫 (小有名气)

自己顶一下

一下为CASTEP结果文件给出的信息


Transition State Found!
Energy of reactant:                 -43366.78455 eV                           
Energy of product:                  -43368.65073 eV                           
Energy of transition state:         -43366.89768 eV                           
Location of transition state:            0.38671
Barrier from reactant:                  -0.11313 eV                           
Barrier from product:                    1.75305 eV                           
Energy of reaction:                     -1.86618 eV

2楼2011-07-13 09:19:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cavediger

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zzy870720z(金币+2): 鼓励交流 2011-07-14 09:37:13
引用回帖:
Originally posted by eyreqiao at 2011-07-12 12:50:09:
利用CASTEP的过渡态搜索,研究单个原子在表面不同位置之间的扩散。
complete LST/QST,过渡态搜索显示成功,但是结果文件中给出的过渡态能量在反应物之下(扩散路径设置的从能量高的吸附位到能量低的吸附位),这 ...

考虑两个问题:
1. 反应物结构选择是否正确,是否优化到了基态?
2. 如果像你图中所示的那样,TS掉下去了,追踪一下迭代过程,考虑是否计算过程出了问题;如果没有问题,那么考虑一下是否存在反应中间物种,针对你的情况,就是是否存在扩散中间态,需要分布考虑扩散过程。
我们都老得太快,却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅,蓦然发现,本来就有一条笔直的路,直达山顶....
3楼2011-07-13 09:43:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

eyreqiao

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by cavediger at 2011-07-13 09:43:27:
考虑两个问题:
1. 反应物结构选择是否正确,是否优化到了基态?
2. 如果像你图中所示的那样,TS掉下去了,追踪一下迭代过程,考虑是否计算过程出了问题;如果没有问题,那么考虑一下是否存在反应中间物种, ...

谢谢!
又重新进行了计算。这次把精度提高为fine,原来为medium,这样rms convergenc 变为0.05

计算结果如下
Transition State Found!
Energy of reactant:                 -43366.78453 eV                           
Energy of product:                  -43368.65072 eV                           
Energy of transition state:         -43366.77850 eV                           
Location of transition state:            0.03827
Barrier from reactant:                   0.00603 eV                           
Barrier from product:                    1.87223 eV                           
Energy of reaction:                     -1.86620 eV

从上述数据看是有一个很小很小的势垒,但这和使用medium精度的计算结果矛盾!
计算精度的影响会这么大吗?
rms是什么意思?

计算的曲线如下,从中看好像过渡态的能量还是低于反应物呀!

那位大小给具体解释下,图中的几个曲线都是什么意思,科普一下吧,谢谢。
4楼2011-07-13 14:42:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见