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starry99木虫 (正式写手)
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高斯计算中离子电荷的处理
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我最近在做gaussian计算离子液体的一些性质，遇到了如下问题： 1、gaussian中离子到底如何表示，gaussian中每个原子仅仅以坐标的形式给出，在输入文件第二行给出的电荷数gaussian是如何知道电荷如何分布的呢。如果对于一个咪唑离子液体，+电荷分布在N上，但是输入文件没有体现出来N的形式电荷。而输出的文件中Mulliken电荷却显示+离子均匀的分布在5元环上，貌似形成了大派键，，两个N的电荷分布竟然是一样的。如果觉得是因为5元环上其他的电子共轭到N上的空轨道也能解释，不知道这样的结果能不能让人信服 2、如果我要处理正负电荷在一起的体系，那么电荷又如何表示呢，我将正负电荷中心对应然后优化构型，因为二者电荷为0我电荷项就设为0。优化的结果觉得构型看起来还是不错的，我把他们当成整体的分子，计算Dipole和Molar Volume但是与文献对应不上不知道为什么。 希望大牛能够帮帮小弟，谢谢～～ |
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12楼2011-07-07 08:13:31
starry99
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2楼2011-07-04 08:03:38
3楼2011-07-04 09:50:09
starry99
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非常谢谢您的回帖，但是我的问题还没有解开。我知道分子的构型是在多个共振结构中转换的，形成大排键也是因为电荷的离域运动造成的。 我现在的问题其实很简单，我特别想知道为什么我的计算结果别人的差别那么大，虽然高斯计算Molar Volume是通过MC方法，必定结果不能完全重现，但是正负离子体系如果结果优化收敛，而且得到多个构型理论上计算结果会比较接近，起码同组的结果趋势会一样，但是我计算的结果却连趋势都不对。 我分析如果出现这样的原因最大的可能是因为我对于带点体系的输入文件错误造成的。我没有处理过带电体系的计算，我只是把总电荷写出，没有其他的标注。 另外的可能性就是因为正负电荷的两体问题没有合适处理，得到的是局部最小值。但是我把正负电荷中心拉到很近让它排斥到合适的位置。而且从4个方向分别优化，理论上不该有什么错误。 希望有经验的虫友帮忙解决，在下感激不已。 |
4楼2011-07-04 11:47:27