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量化新手

新虫 (正式写手)

[求助] AMBER中qm/mm的问题

amber中qm/mm的计算,qm是量子化学的方法,这里面的量子化学方法是可以计算所有gaussian里的东西吗?比如说键长,键角,能量,频率等等!!结果怎么读取啊?那个教程里只是把经典的mm和qm/mm的结果最开始的2步比较了一下,说明qm/mm中不包含的项,但是其他结果怎么读去啊??望大虾指教~~~感激涕零~~~
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-06-25 10:22:47
量化新手(金币+10): 2011-07-14 09:15:24
应该不能完全计算gaussian的内容,因为amber里的QM/MM,其实是QM/MM MD,本质上还是MD,只是QM部分的力是用了半经验的方法计算的(可能不准确,具体的去看manual吧,sorry)。
2楼2011-06-24 22:50:58
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-06-29 10:51:00
另外,你从贴出来的结果看,TEMP过高,而且还在波动,这个要小心!
3楼2011-06-24 22:52:29
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-06-29 10:51:12
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-29 10:51:21
内容已删除
5楼2011-06-29 06:34:10
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