24小时热门版块排行榜    

查看: 3482  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yanhui8558

金虫 (小有名气)

[求助] 重叠pcr\跳跃pcr的问题

我现在在进行重叠pcr,想要把一段基因中间的内含子去除,上游片段1600左右,下游片段500左右,先分别p出上下游片段,然后进行重叠延伸步骤。实验条件如下:
中间上片段下引物和下片段上引物重叠区域大概50个bp,先不加入引物,让上下游引物自连,用的是pcr混合物,pcr条件:
94度3分钟,94度45秒,40度30秒,72度,1分40秒,72度10分钟,2-4步循环10次,然后加入上片段上引物和下片段下引物,pcr条件:
94度3分钟,94度45秒,50度30秒,72度,2分,72度10分钟,2-4步循环30次.
延伸温度也做过50-65的梯度,也加入过DMSO 试验过,
可是一直没有成功,忘各位大侠指导,或者可以指出可能是哪方面的问题啊,感激不尽
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xujian568

至尊木虫 (著名写手)

Count XU

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-06-29 10:54:14
先提个问题,楼主的基因已经克隆到载体了么?
如果长的片段已经克隆到载体,而且只需要去除一个内含子的话,可以直接在你克隆好的载体的基础上设计引物,反向扩增,然后平末端连接。可能退火的时间有点长,不过这样应该没有问题。
只是提个建议。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

活着就要让人感受到你的存在。
9楼2011-06-29 09:47:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

zsy1106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
yanhui8558(金币+1): 2011-06-23 17:01:15
西瓜(金币+3): 鼓励应助 2011-06-23 19:20:26
分段的上下片段都是PCR产物,浓度很高的,但是在第二轮的扩增中其实就是个模板的作用,千万不要加太多了,加多了就把第二轮的引物全部饱和掉了,因为不了解具体情况,也不好建议加多少,方便的话,做个梯度试试。
另外,分段的上下片段在做第二轮之前,稍微纯化下,把第一次PCR之后的残留引物,副产物什么的去掉,避免干扰第二轮的扩增。
试试看吧!
2楼2011-06-23 16:53:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanhui8558

金虫 (小有名气)

已经对上下游片段进行了20、30、40、50、60倍的稀释
3楼2011-06-23 17:00:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwbk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3): 鼓励应助 2011-06-23 20:42:56
yanhui8558(金币+1): 2011-06-24 18:45:29
之前一直在做这类实验

A片段1100,B片段3500
AB片段重叠30bp

A、B片段切胶回收纯化。

A片段上引物和B片段下引物各20bp,加入双模板用量A:B=1:3,按照正常PCR操作直接PCR,体系:50ul。几乎没有失手过。

祝楼主早日成功。
4楼2011-06-23 20:40:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 让我中一个面上吧! +5 大萍1987 2026-08-20 5/250 2026-08-20 20:46 by RRRKKK
[基金申请] 科研孤儿太难了 +12 我4大白菜 2026-08-20 12/600 2026-08-20 20:42 by 6543yes
[基金申请] 言之凿凿,明天官网会通知放榜? +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
请填处理意见