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佳木的复制品

金虫 (正式写手)

[求助] 候选基因功能验证

我通过用T-DNA激活标签(35S)插入突变获得抗旱相关突变体,最后确定了T-DNA附近的A、B、C、D四个候选基因,将这四个候选基因分别构建过表达载体,最后得到A、B、C、D四个候选基因的过表达转基因T0苗各30株。
我的目的是要验证这些候选基因哪个是真的跟抗旱相关,请问:
1)我应该用这些过表达的T0苗来做干旱试验?还是用T0繁种得到的T1,然后用过表达的T1来做干旱试验?还是用过表达的T2来做干旱试验?为什么?
2)如果用T0或T1苗来做验证?需要多少株苗?为什么?(比如我用了30株过表达基因A的T0苗做实验,结果有7株抗旱,23株不抗旱,那怎么去分析这个结果,这个基因A与抗旱相关的吗?如果结果是有23株抗旱,7株不抗旱或者是15株抗旱15株不抗旱,这个结果又该怎么分析呢?)
3)如果用过表达的T2来做实验,由于在T2已经分离了,所以T2植株会有过表达的纯合子和过表达的杂合子,用这个过表达的纯合子和过表达的杂合子做实验有什么区别?
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活着,是为了做点什么!
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webmasterone752

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, EPI+1): 看来又是牛人,呵呵~ 2011-06-23 23:15:21
佳木的复制品(金币+50): 非常感谢!!! 2011-07-08 15:34:08
(1-3)楼主。。档次较高的杂志是不承认T0、T1代得实验结果的啊,也就是说你必须通过T3代来筛选出纯合后用T3代进行实验;同时,至少给出4以上line说明同一表型,才能去说服他们相信你的结果。

因此你ABCD四个基因分别获得了30棵苗,这是个很好的开始啊。虽然后续的筛选工作量大些,但是是很有希望获得好结果的。

最后如果得出结论是ABCD中某个基因有功能,再做它的过表达等等。。。

希望回复对你有帮助。
5楼2011-06-23 22:07:14
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查看全部 6 个回答

ydniu

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

也想知道。帮助楼主顶一下
2楼2011-06-21 16:25:18
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gwbk

木虫 (正式写手)

这个。。。还是比较复杂。帮你顶。
3楼2011-06-21 20:28:22
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helloxiaobo

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+6, EPI+1): 很厉害! 2011-06-23 14:43:58
佳木的复制品(金币+50): 非常感谢!!! 2011-07-08 15:33:58
实验设计:
1 需要增加 互补验证的转化体 确定能够互补突变体表型,方能确定该基因为你要寻找的而目标基因。

2 关于实验数据的分析,首先建立抗旱的指标,不能简单的说是抗还是不抗,比如1级,2级,3级等。在T0代,将目标超标达各转化系(以及对照和突变体)
进行抗旱处理,采集各转化系的抗性等级,及其处理前后目标基因表达定量的数据。

3 当然条件许可用T1和T2来做则更好,可以进行三次重复

4 补充一点:超表达的各转化系有不同的抗性水平是正常的,只要按编号罗列上去就可以了。如有目标基因的表达数据与其匹配,则更加
4楼2011-06-23 12:46:49
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