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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp NEB 如何选取原胞大小 ？
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fangyongxinxi

新虫 (正式写手)

[求助] vasp NEB 如何选取原胞大小 ？

如题，想做一个体系两种结构 A B 之间的过渡态情况。A B 两个体系最小原胞是6个原子，自己做了测试：
将最小原胞设置成过渡态搜索的初始和终态，得到一种过渡态。
然后，将A B 都扩展成18个原子的体系，得到另一个过渡态。
问题：这两种过渡态得到的趋势和过渡态结构都不一样，为什么？自己的想法，想是不是体系初始结构的大小，会严重影响过渡态的计算 ？对于过渡态计算，体系应该选多大合适些 ？
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1楼 2011-06-15 10:45:18
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
fangyongxinxi(金币+5): 2011-06-15 13:51:32
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢指教 2011-06-17 09:29:52
你确定你两个系统的初始路径相同吗？如果相同的话，说明18个原子的体系相变过程中有对称性破坏，中间态不能用6个原子来表达，那么应该是18个原子的原子势垒要小于6个原子的。应该以18个原子的为准。不过这种情况在NEB体系里面很少见。我很怀疑你是否效验了初始路径，用的image过少或者最后没收敛。
另外提醒你一点，你用的是vtst的code吗？那个code是算分子体系，溶液或者是表面吸附体系的。不能算晶体相变的。除非你的初态和末态的元胞一模一样。他要求元胞必须是个不变的框框。见下面的链接。not yet availble for public use。不过这个yet已经好久了。
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/neb/
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5楼2011-06-15 13:38:50
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

【答案】应助回帖

★
fangyongxinxi(金币+2): 2011-06-15 13:54:43
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢交流 2011-06-17 09:29:36
主要是因为你6个原子和18个原子的原子对应方式不同，这样可能导致了不同的相变路径。 自然可能得到两个过渡态。
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真理是一点点接近的！
3楼2011-06-15 13:22:12
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fangyongxinxi

新虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by gavinliu7390 at 2011-06-15 13:22:12:
主要是因为你6个原子和18个原子的原子对应方式不同，这样可能导致了不同的相变路径。 自然可能得到两个过渡态。

对应方式不同，
你指的是初始和终态，两个构型原子的对应方式不一样吗 ？
即：小体系中 a1-b1,a2-b ,a3-b3,a4-b4,a5-b5,a6-b6;
但在大体系中：a1-b2, a2-b1,(其余部分对应正确)..........

我仔细看了两个体系原子的对应方式，都一样。
所以上面说的那种情况不存在。

另外，大家做NEB选取原胞一般多大 ？
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4楼2011-06-15 13:34:11
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

fangyongxinxi(金币+1): 2011-06-15 13:54:58
引用回帖:
Originally posted by fangyongxinxi at 2011-06-15 13:34:11:
对应方式不同，
你指的是初始和终态，两个构型原子的对应方式不一样吗 ？
即：小体系中 a1-b1,a2-b ,a3-b3,a4-b4,a5-b5,a6-b6;
但在大体系中：a1-b2, a2-b1,(其余部分对应正确)..........

我仔细看了两个 ...

大体系和小体系有一个原子错位的话，路径不一样就很正常了
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6楼2011-06-15 13:41:33
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