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小木虫迷

银虫 (正式写手)

[求助] 3株菌的16S rRNA序列已得到,如何知道它们是不是同一种菌?

我从环境样本中筛选到3株菌,做完16S rRNA序列分析后发现,它们的序列中99%以上的是相同序列,请高手解答,如何说明这3株菌到底是同一株,还是不同的?
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lbzx

金虫 (正式写手)

★ ★
rainwander(金币+2): 鼓励交流 2011-06-11 16:30:18
1、利用限制性酶进行酶切,然后电泳
2、形态上有没有差异
3、功能上有没有差异
4、因为即使100%同源也不能100%确定是同一株
5楼2011-06-11 09:35:08
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小木木木虫

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-06-09 18:08:02
小木虫迷(金币+2): 2011-06-10 15:04:41
测序结果的可靠性大一些
所以三个菌可能属同一种
也可以选做一些辅助鉴定
比如显微镜观察,生理生化指标等
个人之见,仅供参考
2楼2011-06-09 17:47:34
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

【答案】应助回帖


rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-06-09 22:30:38
小木虫迷(金币+2): 2011-06-10 15:04:48
小木虫迷(金币+1): 2011-06-10 15:05:39
不是同一株,同一株的话是100%相似(多拷贝16S除外),可能是同一种,还得看形态、生理生化指标等
3楼2011-06-09 17:56:59
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hnzhaolongfei

木虫 (著名写手)

将军


rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-06-09 22:30:46
在做几个持家基因,看比对结果如何,如果是同一株菌,它们的持家基因序列会一样,而16S也一样,基本是同一株菌。再结合理化指标即可决定。
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物
4楼2011-06-09 21:35:01
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