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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 3株菌的16S rRNA序列已得到，如何知道它们是不是同一种菌？
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小木虫迷

银虫 (正式写手)

[求助] 3株菌的16S rRNA序列已得到，如何知道它们是不是同一种菌？

我从环境样本中筛选到3株菌，做完16S rRNA序列分析后发现，它们的序列中99%以上的是相同序列，请高手解答，如何说明这3株菌到底是同一株，还是不同的？
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1楼 2011-06-09 16:30:01
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hnzhaolongfei

木虫 (著名写手)

将军
★
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-06-09 22:30:46
在做几个持家基因，看比对结果如何，如果是同一株菌，它们的持家基因序列会一样，而16S也一样，基本是同一株菌。再结合理化指标即可决定。
赞一下(2人) 回复此楼
天行健，君子以自强不息；地势坤，君子以厚德载物
4楼2011-06-09 21:35:01
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小木木木虫

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-06-09 18:08:02
小木虫迷(金币+2): 2011-06-10 15:04:41
测序结果的可靠性大一些
所以三个菌可能属同一种
也可以选做一些辅助鉴定
比如显微镜观察，生理生化指标等
个人之见，仅供参考
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-06-09 17:47:34
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！

【答案】应助回帖

★
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-06-09 22:30:38
小木虫迷(金币+2): 2011-06-10 15:04:48
小木虫迷(金币+1): 2011-06-10 15:05:39
不是同一株，同一株的话是100%相似（多拷贝16S除外），可能是同一种，还得看形态、生理生化指标等
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3楼2011-06-09 17:56:59
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lbzx

金虫 (正式写手)
★ ★
rainwander(金币+2): 鼓励交流 2011-06-11 16:30:18
1、利用限制性酶进行酶切，然后电泳
2、形态上有没有差异
3、功能上有没有差异
4、因为即使100%同源也不能100%确定是同一株
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2011-06-11 09:35:08
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