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llwwwh

至尊木虫 (职业作家)

[求助] 离子液体的动力学模拟

现在要用MS软件做离子液体的动力学模拟,希望得到离子液体的基本物理化学性质,如密度、粘度、扩散系数和电导率等,已通过量化计算得到稳定结构,但动力学模拟的具体操作没有头绪,请高手指点在MS下应该选择的模块以及如何设置,谢谢!
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时间证明一切
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youjie-888

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

llwwwh(金币+2): 谢谢,很明显我的研究物质你不清楚,离子液体是一种纯物质,由有机阳离子和无机阴离子组成,常温下为液态 2011-06-09 14:21:49
楼主说的很是不清楚,你要模拟什么的溶液,那么这个水溶液的密度定是提前就知道大概值的,然后呢再根据密度的大小建一个合适的水溶液(包括溶质)的模型,然后,你是要知道这个溶液的什么性质,决定了你要在计算机上需算什么。也就是分子动力学计算。
家的感觉
2楼2011-06-09 09:58:39
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llwwwh

至尊木虫 (职业作家)

介绍一下,离子液体是一种纯物质,由有机阳离子和无机阴离子组成,常温下为液态,我想通过模拟纯物质的动力学得到密度、粘度、电导率和扩散系数
时间证明一切
3楼2011-06-09 14:24:08
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043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
贺仪(金币+2): 多谢指教! 2011-06-09 15:07:01
llwwwh(金币+3): 谢谢,我试过上述方法构建,但动力学之后阴阳离子的排布完全无规律,能不能设置离子液体的构象保持稳定 2011-06-09 23:04:21
这个和其他液体模拟是类似的,首先构建初始文件可以使用MS中的Amorphous Cell 模块,然后使用Discover进行动力学模拟.
如果lz是一个动力学模拟新手的话建议先看一些入门的书,否则参数设置和结果分析都是问题.推荐陈正隆的分子模拟和Smit,Frenkel的书,论坛中就有.
4楼2011-06-09 14:55:55
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043114076

木虫 (正式写手)

什么叫排列毫无规律?有没有RDF
5楼2011-06-10 09:37:43
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llwwwh

至尊木虫 (职业作家)

离子液体的结构被破坏了,还有离子跑到了盒子的外面
时间证明一切
6楼2011-06-11 11:02:21
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zxl523

金虫 (著名写手)

引用回帖:
911926楼: Originally posted by youjie-888 at 2011-06-09 09:58:39:
楼主说的很是不清楚,你要模拟什么的溶液,那么这个水溶液的密度定是提前就知道大概值的,然后呢再根据密度的大小建一个合适的水溶液(包括溶质)的模型,然后,你是要知道这个溶液的什么性质,决定了你要在计算机 ...

你好,请教你个问题,我跑的动力学在NPT下密度不断被增大这是什么原因,与参数有关吗,如果参数有问题,那在参数里面有angle 、bond、vwd、charge应该调哪一个?
itisagoodtime.
7楼2012-04-14 19:16:38
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