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做分子对接前选择配体和受体时有什么要求吗?
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lily_llf
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做分子对接前选择配体和受体时有什么要求吗?
各位牛人,在做分子对接前要从很多配体或者受体中选择所要的,选择时有没有什么原则要遵守呢?比如resolution之类的,或者其他的
谢谢!
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2011-06-01 11:04:34
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lily_llf
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Originally posted by
zh1987hs
at 2011-06-01 12:37:40:
resolution当然是重要的一点了~类似的序列一致性的情况下resolution越高越好,此外,注意一下有配体和无配体的同一蛋白质的活性位点结构是否一致,不一致的话可以考虑用结合配体的,现在很多软件都是把配体柔性 ...
非常感谢啊!
还问一下,有没有这方面的论文或书籍啊,或者是要了解这方面的信息要查什么样的关键词,你的回答我大概知道是哪方面的意思,但是还是不太懂,还得补一下基础知识。谢谢啊!
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2011-06-02 08:24:59
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zh1987hs
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御剑江湖(金币+5): 谢谢 2011-06-01 21:00:36
lily_llf(金币+2): 谢谢啊! 2011-06-02 08:16:03
引用回帖:
Originally posted by
lily_llf
at 2011-06-01 11:04:34:
各位牛人,在做分子对接前要从很多配体或者受体中选择所要的,选择时有没有什么原则要遵守呢?比如resolution之类的,或者其他的
谢谢!
resolution当然是重要的一点了~类似的序列一致性的情况下resolution越高越好,此外,注意一下有配体和无配体的同一蛋白质的活性位点结构是否一致,不一致的话可以考虑用结合配体的,现在很多软件都是把配体柔性处理的,但是初始结构对对接结果可能也是有影响的~你可以试试不同的配体初始结构
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2楼
2011-06-01 12:37:40
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zh1987hs
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御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-06-02 18:25:45
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Originally posted by
lily_llf
at 2011-06-02 08:24:59:
非常感谢啊!
还问一下,有没有这方面的论文或书籍啊,或者是要了解这方面的信息要查什么样的关键词,你的回答我大概知道是哪方面的意思,但是还是不太懂,还得补一下基础知识。谢谢啊!
看看不同对接软件的教程和网上相关的英文综述吧!~关于对接的
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4楼
2011-06-02 09:02:46
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zh1987hs
at 2011-06-02 09:02:46:
看看不同对接软件的教程和网上相关的英文综述吧!~关于对接的
嗯,好,谢谢!
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5楼
2011-06-02 09:25:09
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